RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551727.5

NFYB-205, Transcript of nuclear transcription factor Y subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene NFYB, Length 1,727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYB-205ENST00000551727 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.7■■■■■ 6.83
NFYB-205ENST00000551727 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.73■■■■■ 5.71
NFYB-205ENST00000551727 ABCC9O60706 1549 aa48.56■■■■■ 5.36
NFYB-205ENST00000551727 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.37■■■■■ 5.33
NFYB-205ENST00000551727 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.81■■■■■ 5.24
NFYB-205ENST00000551727 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.6■■■■■ 5.21
NFYB-205ENST00000551727 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.5■■■■■ 5.19
NFYB-205ENST00000551727 NACADO15069 1562 aa47.33■■■■■ 5.17
NFYB-205ENST00000551727 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.05■■■■■ 5.12
NFYB-205ENST00000551727 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.41■■■■■ 5.02
NFYB-205ENST00000551727 SCRIBQ14160 1630 aa46.39■■■■■ 5.02
NFYB-205ENST00000551727 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.15■■■■■ 4.98
NFYB-205ENST00000551727 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.62■■■■■ 4.89
NFYB-205ENST00000551727 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.62■■■■■ 4.89
NFYB-205ENST00000551727 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
NFYB-205ENST00000551727 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.8■■■■■ 4.76
NFYB-205ENST00000551727 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.64■■■■■ 4.74
NFYB-205ENST00000551727 SMARCA4P51532 1647 aa44.51■■■■■ 4.72
NFYB-205ENST00000551727 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.5■■■■■ 4.72
NFYB-205ENST00000551727 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
NFYB-205ENST00000551727 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.3■■■■■ 4.68
NFYB-205ENST00000551727 WIZO95785 1651 aa44.14■■■■■ 4.66
NFYB-205ENST00000551727 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.06■■■■■ 4.64
NFYB-205ENST00000551727 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.99■■■■■ 4.63
NFYB-205ENST00000551727 SMARCA2P51531 1590 aa43.91■■■■■ 4.62
NFYB-205ENST00000551727 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.88■■■■■ 4.62
NFYB-205ENST00000551727 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.88■■■■■ 4.62
NFYB-205ENST00000551727 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
NFYB-205ENST00000551727 NCAPD3P42695 1498 aa43.64■■■■■ 4.58
NFYB-205ENST00000551727 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
NFYB-205ENST00000551727 HMGXB3Q12766 1538 aa43.58■■■■■ 4.57
NFYB-205ENST00000551727 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.34■■■■■ 4.53
NFYB-205ENST00000551727 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.18■■■■■ 4.5
NFYB-205ENST00000551727 CFTRP13569 1480 aa42.5■■■■■ 4.39
NFYB-205ENST00000551727 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.44■■■■■ 4.38
NFYB-205ENST00000551727 PRDM2Q13029 1718 aa42.4■■■■■ 4.38
NFYB-205ENST00000551727 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.31■■■■■ 4.36
NFYB-205ENST00000551727 NESP48681 1621 aa42.26■■■■■ 4.36
NFYB-205ENST00000551727 TRIM41Q8WV44 630 aa42.09■■■■■ 4.33
NFYB-205ENST00000551727 ABCC8Q09428 1581 aa42.06■■■■■ 4.32
NFYB-205ENST00000551727 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.96■■■■■ 4.31
NFYB-205ENST00000551727 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.94■■■■■ 4.3
NFYB-205ENST00000551727 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.3
NFYB-205ENST00000551727 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.82■■■■■ 4.29
NFYB-205ENST00000551727 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.78■■■■■ 4.28
NFYB-205ENST00000551727 ERCC6Q03468 1493 aa41.76■■■■■ 4.28
NFYB-205ENST00000551727 SYNJ1O43426 1573 aa41.76■■■■■ 4.28
NFYB-205ENST00000551727 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.7■■■■■ 4.27
NFYB-205ENST00000551727 TOP2BQ02880 1626 aa41.7■■■■■ 4.27
NFYB-205ENST00000551727 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.7■■■■■ 4.27
NFYB-205ENST00000551727 CUX1P39880 1505 aa41.67■■■■■ 4.26
NFYB-205ENST00000551727 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.54■■■■■ 4.24
NFYB-205ENST00000551727 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
NFYB-205ENST00000551727 TOPBP1Q92547 1522 aa41.46■■■■■ 4.23
NFYB-205ENST00000551727 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.43■■■■■ 4.22
NFYB-205ENST00000551727 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
NFYB-205ENST00000551727 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
NFYB-205ENST00000551727 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.3■■■■■ 4.2
NFYB-205ENST00000551727 WDR62O43379 1518 aa41.27■■■■■ 4.2
NFYB-205ENST00000551727 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
NFYB-205ENST00000551727 SOGA1O94964 1423 aa41.11■■■■■ 4.17
NFYB-205ENST00000551727 EEA1Q15075 1411 aa41.02■■■■■ 4.16
NFYB-205ENST00000551727 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41■■■■■ 4.15
NFYB-205ENST00000551727 CUX2O14529 1486 aa40.99■■■■■ 4.15
NFYB-205ENST00000551727 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.98■■■■■ 4.15
NFYB-205ENST00000551727 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.97■■■■■ 4.15
NFYB-205ENST00000551727 WDR97A6NE52 1622 aa40.97■■■■■ 4.15
NFYB-205ENST00000551727 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
NFYB-205ENST00000551727 KIF27Q86VH2 1401 aa40.89■■■■■ 4.14
NFYB-205ENST00000551727 IFT140Q96RY7 1462 aa40.83■■■■■ 4.13
NFYB-205ENST00000551727 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.75■■■■■ 4.11
NFYB-205ENST00000551727 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.73■■■■■ 4.11
NFYB-205ENST00000551727 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.72■■■■■ 4.11
NFYB-205ENST00000551727 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.64■■■■■ 4.1
NFYB-205ENST00000551727 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
NFYB-205ENST00000551727 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.6■■■■■ 4.09
NFYB-205ENST00000551727 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
NFYB-205ENST00000551727 IGF1RP08069 1367 aa40.56■■■■■ 4.08
NFYB-205ENST00000551727 KIF21BO75037 1637 aa40.54■■■■■ 4.08
NFYB-205ENST00000551727 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.51■■■■■ 4.08
NFYB-205ENST00000551727 PBRM1Q86U86 1689 aa40.5■■■■■ 4.07
NFYB-205ENST00000551727 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
NFYB-205ENST00000551727 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.07
NFYB-205ENST00000551727 PRXQ9BXM0 1461 aa40.48■■■■■ 4.07
NFYB-205ENST00000551727 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
NFYB-205ENST00000551727 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.45■■■■■ 4.07
NFYB-205ENST00000551727 GOLGA3Q08378 1498 aa40.44■■■■■ 4.06
NFYB-205ENST00000551727 CUL7Q14999 1698 aa40.44■■■■■ 4.06
NFYB-205ENST00000551727 GRIN2BQ13224 1484 aa40.39■■■■■ 4.06
NFYB-205ENST00000551727 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.34■■■■■ 4.05
NFYB-205ENST00000551727 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.33■■■■■ 4.05
NFYB-205ENST00000551727 CEP162Q5TB80 1403 aa40.29■■■■■ 4.04
NFYB-205ENST00000551727 ADAMTS12P58397 1594 aa40.21■■■■■ 4.03
NFYB-205ENST00000551727 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
NFYB-205ENST00000551727 HRCP23327 699 aa40.16■■■■■ 4.02
NFYB-205ENST00000551727 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.16■■■■■ 4.02
NFYB-205ENST00000551727 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.16■■■■■ 4.02
NFYB-205ENST00000551727 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
NFYB-205ENST00000551727 SYNJ2O15056 1496 aa39.98■■■■□ 3.99
NFYB-205ENST00000551727 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.92■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms