Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD1Q15797 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMAD1Q15797 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMAD1Q15797 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAD1Q15797 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD1Q15797 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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