Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTRK1P04629 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK1P04629 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK1P04629 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK1P04629 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms