Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXNB1O43157 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXNB1O43157 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLXNB1O43157 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 765.7 ms