Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNB1O43157 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLXNB1O43157 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNB1O43157 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNB1O43157 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNB1O43157 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNB1O43157 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNB1O43157 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNB1O43157 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNB1O43157 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNB1O43157 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNB1O43157 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNB1O43157 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNB1O43157 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNB1O43157 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNB1O43157 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNB1O43157 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXNB1O43157 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXNB1O43157 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNB1O43157 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNB1O43157 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNB1O43157 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNB1O43157 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNB1O43157 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNB1O43157 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNB1O43157 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNB1O43157 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNB1O43157 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXNB1O43157 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXNB1O43157 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXNB1O43157 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNB1O43157 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNB1O43157 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNB1O43157 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNB1O43157 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNB1O43157 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNB1O43157 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNB1O43157 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNB1O43157 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNB1O43157 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNB1O43157 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNB1O43157 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNB1O43157 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNB1O43157 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNB1O43157 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNB1O43157 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNB1O43157 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNB1O43157 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNB1O43157 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNB1O43157 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNB1O43157 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNB1O43157 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNB1O43157 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNB1O43157 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNB1O43157 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNB1O43157 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNB1O43157 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNB1O43157 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNB1O43157 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNB1O43157 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNB1O43157 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNB1O43157 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNB1O43157 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNB1O43157 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNB1O43157 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNB1O43157 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNB1O43157 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNB1O43157 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNB1O43157 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNB1O43157 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNB1O43157 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNB1O43157 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB1O43157 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB1O43157 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB1O43157 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNB1O43157 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNB1O43157 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNB1O43157 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNB1O43157 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNB1O43157 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNB1O43157 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNB1O43157 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB1O43157 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNB1O43157 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNB1O43157 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNB1O43157 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNB1O43157 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB1O43157 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB1O43157 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNB1O43157 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNB1O43157 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNB1O43157 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNB1O43157 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNB1O43157 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNB1O43157 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNB1O43157 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNB1O43157 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNB1O43157 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNB1O43157 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXNB1O43157 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms