Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DYNC1LI1Q9Y6G9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI1Q9Y6G9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DYNC1LI1Q9Y6G9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DYNC1LI1Q9Y6G9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DYNC1LI1Q9Y6G9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DYNC1LI1Q9Y6G9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DYNC1LI1Q9Y6G9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms