Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MAD1L1Q9Y6D9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAD1L1Q9Y6D9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAD1L1Q9Y6D9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MAD1L1Q9Y6D9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAD1L1Q9Y6D9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAD1L1Q9Y6D9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAD1L1Q9Y6D9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAD1L1Q9Y6D9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAD1L1Q9Y6D9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAD1L1Q9Y6D9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAD1L1Q9Y6D9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAD1L1Q9Y6D9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAD1L1Q9Y6D9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms