Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPG1Q9Y678 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPG1Q9Y678 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COPG1Q9Y678 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPG1Q9Y678 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPG1Q9Y678 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPG1Q9Y678 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPG1Q9Y678 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPG1Q9Y678 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPG1Q9Y678 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPG1Q9Y678 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPG1Q9Y678 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPG1Q9Y678 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPG1Q9Y678 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
COPG1Q9Y678 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPG1Q9Y678 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms