Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COPG1Q9Y678 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COPG1Q9Y678 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COPG1Q9Y678 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
COPG1Q9Y678 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
COPG1Q9Y678 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
COPG1Q9Y678 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
COPG1Q9Y678 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
COPG1Q9Y678 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
COPG1Q9Y678 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COPG1Q9Y678 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
COPG1Q9Y678 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
COPG1Q9Y678 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
COPG1Q9Y678 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
COPG1Q9Y678 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
COPG1Q9Y678 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
COPG1Q9Y678 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
COPG1Q9Y678 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COPG1Q9Y678 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
COPG1Q9Y678 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
COPG1Q9Y678 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
COPG1Q9Y678 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
COPG1Q9Y678 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
COPG1Q9Y678 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COPG1Q9Y678 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
COPG1Q9Y678 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COPG1Q9Y678 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COPG1Q9Y678 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COPG1Q9Y678 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COPG1Q9Y678 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COPG1Q9Y678 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COPG1Q9Y678 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COPG1Q9Y678 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COPG1Q9Y678 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COPG1Q9Y678 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COPG1Q9Y678 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COPG1Q9Y678 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COPG1Q9Y678 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COPG1Q9Y678 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COPG1Q9Y678 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COPG1Q9Y678 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COPG1Q9Y678 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COPG1Q9Y678 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COPG1Q9Y678 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COPG1Q9Y678 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COPG1Q9Y678 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COPG1Q9Y678 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COPG1Q9Y678 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COPG1Q9Y678 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COPG1Q9Y678 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COPG1Q9Y678 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COPG1Q9Y678 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
COPG1Q9Y678 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPG1Q9Y678 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COPG1Q9Y678 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPG1Q9Y678 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
COPG1Q9Y678 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COPG1Q9Y678 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COPG1Q9Y678 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COPG1Q9Y678 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COPG1Q9Y678 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COPG1Q9Y678 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COPG1Q9Y678 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COPG1Q9Y678 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COPG1Q9Y678 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COPG1Q9Y678 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COPG1Q9Y678 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COPG1Q9Y678 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COPG1Q9Y678 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COPG1Q9Y678 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COPG1Q9Y678 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COPG1Q9Y678 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COPG1Q9Y678 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COPG1Q9Y678 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COPG1Q9Y678 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COPG1Q9Y678 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COPG1Q9Y678 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COPG1Q9Y678 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COPG1Q9Y678 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COPG1Q9Y678 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COPG1Q9Y678 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COPG1Q9Y678 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COPG1Q9Y678 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COPG1Q9Y678 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COPG1Q9Y678 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COPG1Q9Y678 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COPG1Q9Y678 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
COPG1Q9Y678 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COPG1Q9Y678 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COPG1Q9Y678 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COPG1Q9Y678 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPG1Q9Y678 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COPG1Q9Y678 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COPG1Q9Y678 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPG1Q9Y678 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPG1Q9Y678 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COPG1Q9Y678 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COPG1Q9Y678 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COPG1Q9Y678 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COPG1Q9Y678 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms