Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPTNQ9Y664 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KPTNQ9Y664 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPTNQ9Y664 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPTNQ9Y664 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KPTNQ9Y664 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KPTNQ9Y664 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPTNQ9Y664 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPTNQ9Y664 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPTNQ9Y664 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPTNQ9Y664 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPTNQ9Y664 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPTNQ9Y664 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KPTNQ9Y664 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPTNQ9Y664 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPTNQ9Y664 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms