Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y316

MEMO1, Protein MEMO1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEMO1Q9Y316 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEMO1Q9Y316 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEMO1Q9Y316 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEMO1Q9Y316 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEMO1Q9Y316 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEMO1Q9Y316 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEMO1Q9Y316 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms