Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPT2Q9UMR5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPT2Q9UMR5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPT2Q9UMR5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPT2Q9UMR5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPT2Q9UMR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPT2Q9UMR5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPT2Q9UMR5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPT2Q9UMR5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPT2Q9UMR5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms