Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCC2Q9P258 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCC2Q9P258 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCC2Q9P258 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCC2Q9P258 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RCC2Q9P258 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCC2Q9P258 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms