Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COA4Q9NYJ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COA4Q9NYJ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COA4Q9NYJ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COA4Q9NYJ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COA4Q9NYJ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COA4Q9NYJ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COA4Q9NYJ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COA4Q9NYJ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COA4Q9NYJ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COA4Q9NYJ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COA4Q9NYJ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COA4Q9NYJ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COA4Q9NYJ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COA4Q9NYJ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COA4Q9NYJ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms