Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COA4Q9NYJ1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COA4Q9NYJ1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COA4Q9NYJ1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COA4Q9NYJ1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COA4Q9NYJ1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COA4Q9NYJ1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COA4Q9NYJ1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
COA4Q9NYJ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COA4Q9NYJ1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COA4Q9NYJ1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COA4Q9NYJ1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COA4Q9NYJ1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COA4Q9NYJ1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COA4Q9NYJ1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COA4Q9NYJ1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COA4Q9NYJ1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COA4Q9NYJ1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COA4Q9NYJ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COA4Q9NYJ1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COA4Q9NYJ1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COA4Q9NYJ1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COA4Q9NYJ1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COA4Q9NYJ1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COA4Q9NYJ1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COA4Q9NYJ1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COA4Q9NYJ1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COA4Q9NYJ1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COA4Q9NYJ1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COA4Q9NYJ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA4Q9NYJ1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COA4Q9NYJ1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COA4Q9NYJ1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COA4Q9NYJ1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COA4Q9NYJ1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COA4Q9NYJ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COA4Q9NYJ1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COA4Q9NYJ1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COA4Q9NYJ1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COA4Q9NYJ1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COA4Q9NYJ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COA4Q9NYJ1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COA4Q9NYJ1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COA4Q9NYJ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COA4Q9NYJ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COA4Q9NYJ1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COA4Q9NYJ1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COA4Q9NYJ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COA4Q9NYJ1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COA4Q9NYJ1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COA4Q9NYJ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COA4Q9NYJ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COA4Q9NYJ1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COA4Q9NYJ1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COA4Q9NYJ1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COA4Q9NYJ1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COA4Q9NYJ1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COA4Q9NYJ1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COA4Q9NYJ1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COA4Q9NYJ1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COA4Q9NYJ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COA4Q9NYJ1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COA4Q9NYJ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COA4Q9NYJ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COA4Q9NYJ1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COA4Q9NYJ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COA4Q9NYJ1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COA4Q9NYJ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COA4Q9NYJ1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COA4Q9NYJ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COA4Q9NYJ1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COA4Q9NYJ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COA4Q9NYJ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COA4Q9NYJ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COA4Q9NYJ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COA4Q9NYJ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COA4Q9NYJ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COA4Q9NYJ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COA4Q9NYJ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COA4Q9NYJ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COA4Q9NYJ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COA4Q9NYJ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COA4Q9NYJ1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
COA4Q9NYJ1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COA4Q9NYJ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COA4Q9NYJ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COA4Q9NYJ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COA4Q9NYJ1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COA4Q9NYJ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COA4Q9NYJ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COA4Q9NYJ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COA4Q9NYJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COA4Q9NYJ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COA4Q9NYJ1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COA4Q9NYJ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COA4Q9NYJ1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COA4Q9NYJ1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COA4Q9NYJ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COA4Q9NYJ1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COA4Q9NYJ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms