Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 54.1
RBM22Q9NW64 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 54.1
RBM22Q9NW64 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.378e-8■■■■■ 54.1
RBM22Q9NW64 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.488e-8■■■■■ 54.1
RBM22Q9NW64 PGK1-203ENST00000476531 960 ntTSL 210.53□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 54
RBM22Q9NW64 ARPC2-217ENST00000489598 1039 ntTSL 225.55■■□□□ 1.681e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-204ENST00000420104 482 ntTSL 325.55■■□□□ 1.681e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-214ENST00000480062 508 ntTSL 225.44■■□□□ 1.661e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.661e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.651e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-203ENST00000414983 713 ntTSL 324.47■■□□□ 1.511e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-218ENST00000491780 577 ntTSL 424.35■■□□□ 1.491e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-205ENST00000420201 732 ntTSL 323.86■■□□□ 1.411e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-215ENST00000484961 722 ntTSL 316.08■□□□□ 0.161e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-208ENST00000465395 816 ntTSL 27.85□□□□□ -1.151e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-210ENST00000471355 602 ntTSL 22.64□□□□□ -1.991e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-211ENST00000472753 503 ntTSL 32.26□□□□□ -2.051e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 ARPC2-213ENST00000478612 528 ntTSL 31.09□□□□□ -2.231e-11■■■■■ 53.9
RBM22Q9NW64 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 524.92■■□□□ 1.584e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 520.67■□□□□ 0.94e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.84e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.694e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.614e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 P3H1-207ENST00000460031 2726 ntTSL 517.27■□□□□ 0.364e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 516.39■□□□□ 0.214e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 P3H1-214ENST00000495874 2813 ntTSL 216.21■□□□□ 0.194e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.14e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 P3H1-211ENST00000472802 646 ntTSL 213.96□□□□□ -0.174e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 P3H1-209ENST00000462474 581 ntTSL 213□□□□□ -0.334e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 SQSTM1-206ENST00000466342 808 ntTSL 211.94□□□□□ -0.54e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 CCT5-203ENST00000503026 1933 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.514e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 STK38-201ENST00000229812 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.954e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 CCT5-202ENST00000423695 1232 ntTSL 28.48□□□□□ -1.054e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.144e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 47.65□□□□□ -1.184e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 CHD2-227ENST00000637572 4452 ntTSL 55.67□□□□□ -1.54e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 LDLR-209ENST00000558528 456 ntTSL 25.12□□□□□ -1.594e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 CHD2-214ENST00000628181 545 ntTSL 54.41□□□□□ -1.74e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 52.29□□□□□ -2.044e-10■■■■■ 53.8
RBM22Q9NW64 TRIM28-211ENST00000597968 504 ntTSL 213.53□□□□□ -0.241e-11■■■■■ 53.6
RBM22Q9NW64 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 53.2
RBM22Q9NW64 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-14■■■■■ 53.2
RBM22Q9NW64 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 01e-7■■■■■ 53.2
RBM22Q9NW64 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 53.2
RBM22Q9NW64 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 53.2
RBM22Q9NW64 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 53.2
RBM22Q9NW64 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 53.2
RBM22Q9NW64 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.335e-12■■■■■ 52.9
RBM22Q9NW64 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.325e-12■■■■■ 52.9
RBM22Q9NW64 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 324.59■■□□□ 1.531e-19■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.171e-19■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 317.07■□□□□ 0.321e-12■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 216.56■□□□□ 0.241e-12■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)13.06□□□□□ -0.321e-12■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 511.22□□□□□ -0.611e-12■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.661e-12■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.721e-12■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.851e-12■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.921e-12■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 MYB-240ENST00000534736 801 ntTSL 1 (best)4.19□□□□□ -1.744e-9■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 NUP214-215ENST00000525980 2274 ntTSL 28.99□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 52.7
RBM22Q9NW64 RSRP1-216ENST00000568212 570 ntTSL 413.44□□□□□ -0.267e-34■■■■■ 52.5
RBM22Q9NW64 NFKBIZ-208ENST00000486444 613 ntTSL 320.47■□□□□ 0.875e-21■■■■■ 52.5
RBM22Q9NW64 NFKBIZ-207ENST00000483180 2006 ntTSL 59.26□□□□□ -0.935e-21■■■■■ 52.5
RBM22Q9NW64 NFKBIZ-209ENST00000491281 564 ntTSL 44.61□□□□□ -1.675e-21■■■■■ 52.5
RBM22Q9NW64 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.349e-7■■■■■ 52.4
RBM22Q9NW64 AC009163.4-202ENST00000561887 137 ntTSL 213.04□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 52.4
RBM22Q9NW64 AC009163.4-203ENST00000566594 254 ntTSL 213.04□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 52.4
RBM22Q9NW64 CFDP1-205ENST00000565646 608 ntTSL 312.94□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 52.4
RBM22Q9NW64 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 52.4
RBM22Q9NW64 CFDP1-207ENST00000566901 1167 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 52.4
RBM22Q9NW64 CFDP1-203ENST00000564286 775 ntTSL 510.54□□□□□ -0.729e-7■■■■■ 52.4
RBM22Q9NW64 CFDP1-206ENST00000566254 342 ntTSL 38.57□□□□□ -1.049e-7■■■■■ 52.4
RBM22Q9NW64 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.791e-37■■■■■ 52.3
RBM22Q9NW64 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.531e-37■■■■■ 52.3
RBM22Q9NW64 UBC-208ENST00000540700 627 ntTSL 216.91■□□□□ 0.31e-37■■■■■ 52.3
RBM22Q9NW64 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.071e-37■■■■■ 52.3
RBM22Q9NW64 UBC-204ENST00000536661 624 ntTSL 214.97□□□□□ -0.011e-37■■■■■ 52.3
RBM22Q9NW64 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.831e-37■■■■■ 52.3
RBM22Q9NW64 UBC-211ENST00000542416 517 ntTSL 48.8□□□□□ -11e-37■■■■■ 52.3
RBM22Q9NW64 RHOT2-217ENST00000567589 550 ntTSL 319.83■□□□□ 0.776e-11■■■■■ 52
RBM22Q9NW64 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.569e-8■■■■■ 51.9
RBM22Q9NW64 GLUL-210ENST00000484996 1369 ntTSL 321.26■□□□□ 0.992e-9■■■■■ 51.8
RBM22Q9NW64 GLUL-211ENST00000489818 683 ntTSL 39.86□□□□□ -0.832e-9■■■■■ 51.8
RBM22Q9NW64 GLUL-208ENST00000475808 868 ntTSL 28.87□□□□□ -0.991e-11■■■■■ 51.8
RBM22Q9NW64 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.871e-19■■■■■ 51.6
RBM22Q9NW64 LIN54-208ENST00000509748 729 ntTSL 521.24■□□□□ 0.995e-13■■■■■ 51.5
RBM22Q9NW64 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.665e-13■■■■■ 51.5
RBM22Q9NW64 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.315e-13■■■■■ 51.5
RBM22Q9NW64 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.51e-11■■■■■ 51.5
RBM22Q9NW64 RPL35-203ENST00000487431 785 ntTSL 1 (best)21.27■■□□□ 13e-12■■■■■ 51.4
RBM22Q9NW64 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-12■■■■■ 51.4
RBM22Q9NW64 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-12■■■■■ 51.4
RBM22Q9NW64 RPL35-204ENST00000493018 692 ntTSL 313.77□□□□□ -0.213e-12■■■■■ 51.4
RBM22Q9NW64 RPL35-202ENST00000373570 493 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.923e-12■■■■■ 51.4
RBM22Q9NW64 RPL5-204ENST00000470843 694 ntTSL 34.28□□□□□ -1.725e-12■■■■■ 51.3
RBM22Q9NW64 RPL5-203ENST00000461952 1116 ntTSL 24.2□□□□□ -1.745e-12■■■■■ 51.3
RBM22Q9NW64 KIAA0368-205ENST00000602447 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.76■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 50.9
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