RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521577.1

LARP1-211, Transcript of La ribonucleoprotein domain family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene LARP1, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1-211ENST00000521577 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.22■■■■■ 7.07
LARP1-211ENST00000521577 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.53■■■■■ 6
LARP1-211ENST00000521577 ABCC9O60706 1549 aa51.1■■■■■ 5.77
LARP1-211ENST00000521577 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
LARP1-211ENST00000521577 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.37■■■■■ 5.49
LARP1-211ENST00000521577 NACADO15069 1562 aa49.31■■■■■ 5.48
LARP1-211ENST00000521577 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.29■■■■■ 5.48
LARP1-211ENST00000521577 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.09■■■■■ 5.45
LARP1-211ENST00000521577 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49■■■■■ 5.43
LARP1-211ENST00000521577 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.18■■■■■ 5.3
LARP1-211ENST00000521577 SCRIBQ14160 1630 aa47.96■■■■■ 5.27
LARP1-211ENST00000521577 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.8■■■■■ 5.24
LARP1-211ENST00000521577 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.78■■■■■ 5.24
LARP1-211ENST00000521577 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.3■■■■■ 5.16
LARP1-211ENST00000521577 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.58■■■■■ 5.05
LARP1-211ENST00000521577 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
LARP1-211ENST00000521577 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.24■■■■■ 4.99
LARP1-211ENST00000521577 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.09■■■■■ 4.97
LARP1-211ENST00000521577 SMARCA4P51532 1647 aa45.9■■■■■ 4.94
LARP1-211ENST00000521577 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.88■■■■■ 4.94
LARP1-211ENST00000521577 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.65■■■■■ 4.9
LARP1-211ENST00000521577 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.55■■■■■ 4.88
LARP1-211ENST00000521577 SMARCA2P51531 1590 aa45.53■■■■■ 4.88
LARP1-211ENST00000521577 NCAPD3P42695 1498 aa45.48■■■■■ 4.87
LARP1-211ENST00000521577 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.42■■■■■ 4.86
LARP1-211ENST00000521577 HMGXB3Q12766 1538 aa45.3■■■■■ 4.84
LARP1-211ENST00000521577 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
LARP1-211ENST00000521577 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
LARP1-211ENST00000521577 WIZO95785 1651 aa45.18■■■■■ 4.82
LARP1-211ENST00000521577 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
LARP1-211ENST00000521577 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
LARP1-211ENST00000521577 NESP48681 1621 aa44.3■■■■■ 4.68
LARP1-211ENST00000521577 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.25■■■■■ 4.67
LARP1-211ENST00000521577 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.19■■■■■ 4.66
LARP1-211ENST00000521577 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.18■■■■■ 4.66
LARP1-211ENST00000521577 ERCC6Q03468 1493 aa44.03■■■■■ 4.64
LARP1-211ENST00000521577 CFTRP13569 1480 aa43.97■■■■■ 4.63
LARP1-211ENST00000521577 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.94■■■■■ 4.62
LARP1-211ENST00000521577 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.81■■■■■ 4.6
LARP1-211ENST00000521577 PRDM2Q13029 1718 aa43.7■■■■■ 4.59
LARP1-211ENST00000521577 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.68■■■■■ 4.58
LARP1-211ENST00000521577 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.61■■■■■ 4.57
LARP1-211ENST00000521577 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
LARP1-211ENST00000521577 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.48■■■■■ 4.55
LARP1-211ENST00000521577 CUX2O14529 1486 aa43.44■■■■■ 4.54
LARP1-211ENST00000521577 WDR62O43379 1518 aa43.32■■■■■ 4.52
LARP1-211ENST00000521577 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
LARP1-211ENST00000521577 ABCC8Q09428 1581 aa43.03■■■■■ 4.48
LARP1-211ENST00000521577 TOPBP1Q92547 1522 aa43.02■■■■■ 4.48
LARP1-211ENST00000521577 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43■■■■■ 4.47
LARP1-211ENST00000521577 CUX1P39880 1505 aa42.81■■■■■ 4.44
LARP1-211ENST00000521577 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
LARP1-211ENST00000521577 IFT140Q96RY7 1462 aa42.68■■■■■ 4.42
LARP1-211ENST00000521577 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.65■■■■■ 4.421e-6■■■■□ 20.2
LARP1-211ENST00000521577 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.62■■■■■ 4.41
LARP1-211ENST00000521577 SYNJ1O43426 1573 aa42.53■■■■■ 4.4
LARP1-211ENST00000521577 TOP2BQ02880 1626 aa42.53■■■■■ 4.4
LARP1-211ENST00000521577 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
LARP1-211ENST00000521577 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.53■■■■■ 4.4
LARP1-211ENST00000521577 SOGA1O94964 1423 aa42.5■■■■■ 4.39
LARP1-211ENST00000521577 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.49■■■■■ 4.39
LARP1-211ENST00000521577 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
LARP1-211ENST00000521577 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
LARP1-211ENST00000521577 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.25■■■■■ 4.351e-8■■■■□ 26.1
LARP1-211ENST00000521577 WDR97A6NE52 1622 aa42.25■■■■■ 4.35
LARP1-211ENST00000521577 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
LARP1-211ENST00000521577 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.21■■■■■ 4.35
LARP1-211ENST00000521577 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.03■■■■■ 4.32
LARP1-211ENST00000521577 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.02■■■■■ 4.32
LARP1-211ENST00000521577 GRIN2BQ13224 1484 aa41.98■■■■■ 4.31
LARP1-211ENST00000521577 PBRM1Q86U86 1689 aa41.93■■■■■ 4.3
LARP1-211ENST00000521577 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.88■■■■■ 4.29
LARP1-211ENST00000521577 TRIM41Q8WV44 630 aa41.87■■■■■ 4.29
LARP1-211ENST00000521577 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
LARP1-211ENST00000521577 KIF27Q86VH2 1401 aa41.74■■■■■ 4.27
LARP1-211ENST00000521577 CHD1O14646 1710 aa41.72■■■■■ 4.27
LARP1-211ENST00000521577 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.72■■■■■ 4.27
LARP1-211ENST00000521577 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.72■■■■■ 4.27
LARP1-211ENST00000521577 FBLN2P98095 1184 aa41.7■■■■■ 4.27
LARP1-211ENST00000521577 OSCARQ8IYS5 282 aa41.69■■■■■ 4.26
LARP1-211ENST00000521577 SYNJ2O15056 1496 aa41.66■■■■■ 4.26
LARP1-211ENST00000521577 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
LARP1-211ENST00000521577 ADAMTS12P58397 1594 aa41.61■■■■■ 4.25
LARP1-211ENST00000521577 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.55■■■■■ 4.24
LARP1-211ENST00000521577 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.54■■■■■ 4.24
LARP1-211ENST00000521577 IGF1RP08069 1367 aa41.51■■■■■ 4.24
LARP1-211ENST00000521577 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.44■■■■■ 4.23
LARP1-211ENST00000521577 GRIN2AQ12879 1464 aa41.43■■■■■ 4.22
LARP1-211ENST00000521577 CUL7Q14999 1698 aa41.42■■■■■ 4.22
LARP1-211ENST00000521577 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.29■■■■■ 4.2
LARP1-211ENST00000521577 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.26■■■■■ 4.2
LARP1-211ENST00000521577 NUP160Q12769 1436 aa41.23■■■■■ 4.19
LARP1-211ENST00000521577 CEP170Q5SW79 1584 aa41.21■■■■■ 4.19
LARP1-211ENST00000521577 EEA1Q15075 1411 aa41.14■■■■■ 4.18
LARP1-211ENST00000521577 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.09■■■■■ 4.17
LARP1-211ENST00000521577 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.05■■■■■ 4.16
LARP1-211ENST00000521577 ARHGEF11O15085 1522 aa41.02■■■■■ 4.16
LARP1-211ENST00000521577 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41■■■■■ 4.15
LARP1-211ENST00000521577 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41■■■■■ 4.15
LARP1-211ENST00000521577 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms