RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495874.5

P3H1-214, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene P3H1, Length 2,813 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-214ENST00000495874 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.29■■■□□ 2.92
P3H1-214ENST00000495874 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.67■■■□□ 2.18
P3H1-214ENST00000495874 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.22■■■□□ 2.11
P3H1-214ENST00000495874 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.16■■■□□ 2.1
P3H1-214ENST00000495874 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
P3H1-214ENST00000495874 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
P3H1-214ENST00000495874 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.16■■□□□ 1.94
P3H1-214ENST00000495874 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.99■■□□□ 1.91
P3H1-214ENST00000495874 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.93■■□□□ 1.9
P3H1-214ENST00000495874 SCRIBQ14160 1630 aa26.69■■□□□ 1.86
P3H1-214ENST00000495874 ABCC9O60706 1549 aa26.64■■□□□ 1.85
P3H1-214ENST00000495874 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.37■■□□□ 1.81
P3H1-214ENST00000495874 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
P3H1-214ENST00000495874 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.17■■□□□ 1.78
P3H1-214ENST00000495874 NACADO15069 1562 aa26.16■■□□□ 1.78
P3H1-214ENST00000495874 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.11■■□□□ 1.77
P3H1-214ENST00000495874 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.11■■□□□ 1.77
P3H1-214ENST00000495874 TRIM41Q8WV44 630 aa26.02■■□□□ 1.76
P3H1-214ENST00000495874 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
P3H1-214ENST00000495874 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.96■■□□□ 1.75
P3H1-214ENST00000495874 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.96■■□□□ 1.75
P3H1-214ENST00000495874 HRCP23327 699 aa25.92■■□□□ 1.74
P3H1-214ENST00000495874 WIZO95785 1651 aa25.81■■□□□ 1.72
P3H1-214ENST00000495874 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
P3H1-214ENST00000495874 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.692e-6■□□□□ 11
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P3H1-214ENST00000495874 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
P3H1-214ENST00000495874 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.48■■□□□ 1.67
P3H1-214ENST00000495874 SMARCA4P51532 1647 aa25.37■■□□□ 1.65
P3H1-214ENST00000495874 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
P3H1-214ENST00000495874 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
P3H1-214ENST00000495874 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.28■■□□□ 1.64
P3H1-214ENST00000495874 ABCC8Q09428 1581 aa25.25■■□□□ 1.63
P3H1-214ENST00000495874 SMARCA2P51531 1590 aa25.21■■□□□ 1.63
P3H1-214ENST00000495874 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.18■■□□□ 1.62
P3H1-214ENST00000495874 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
P3H1-214ENST00000495874 SOGA1O94964 1423 aa25■■□□□ 1.59
P3H1-214ENST00000495874 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.91■■□□□ 1.58
P3H1-214ENST00000495874 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
P3H1-214ENST00000495874 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.83■■□□□ 1.57
P3H1-214ENST00000495874 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.8■■□□□ 1.56
P3H1-214ENST00000495874 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.79■■□□□ 1.56
P3H1-214ENST00000495874 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
P3H1-214ENST00000495874 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
P3H1-214ENST00000495874 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
P3H1-214ENST00000495874 CEP162Q5TB80 1403 aa24.75■■□□□ 1.55
P3H1-214ENST00000495874 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
P3H1-214ENST00000495874 SYNJ1O43426 1573 aa24.66■■□□□ 1.54
P3H1-214ENST00000495874 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.65■■□□□ 1.54
P3H1-214ENST00000495874 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
P3H1-214ENST00000495874 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
P3H1-214ENST00000495874 EEA1Q15075 1411 aa24.6■■□□□ 1.53
P3H1-214ENST00000495874 GOLGA3Q08378 1498 aa24.54■■□□□ 1.52
P3H1-214ENST00000495874 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.39■■□□□ 1.5
P3H1-214ENST00000495874 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.36■■□□□ 1.49
P3H1-214ENST00000495874 CLIP1P30622 1438 aa24.33■■□□□ 1.49
P3H1-214ENST00000495874 KIF21BO75037 1637 aa24.33■■□□□ 1.49
P3H1-214ENST00000495874 TOP2BQ02880 1626 aa24.28■■□□□ 1.48
P3H1-214ENST00000495874 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
P3H1-214ENST00000495874 NCAPD3P42695 1498 aa24.27■■□□□ 1.48
P3H1-214ENST00000495874 APLP2Q06481 763 aa24.23■■□□□ 1.47
P3H1-214ENST00000495874 HMGXB3Q12766 1538 aa24.2■■□□□ 1.46
P3H1-214ENST00000495874 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.16■■□□□ 1.46
P3H1-214ENST00000495874 CUX1P39880 1505 aa24.15■■□□□ 1.46
P3H1-214ENST00000495874 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.15■■□□□ 1.46
P3H1-214ENST00000495874 CFTRP13569 1480 aa24.06■■□□□ 1.44
P3H1-214ENST00000495874 PRXQ9BXM0 1461 aa24.04■■□□□ 1.44
P3H1-214ENST00000495874 KIF27Q86VH2 1401 aa24■■□□□ 1.43
P3H1-214ENST00000495874 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
P3H1-214ENST00000495874 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.94■■□□□ 1.42
P3H1-214ENST00000495874 ARAP1Q96P48 1450 aa23.94■■□□□ 1.42
P3H1-214ENST00000495874 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
P3H1-214ENST00000495874 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.89■■□□□ 1.42
P3H1-214ENST00000495874 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
P3H1-214ENST00000495874 CUX2O14529 1486 aa23.88■■□□□ 1.41
P3H1-214ENST00000495874 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.83■■□□□ 1.41
P3H1-214ENST00000495874 ITGAEP38570 1179 aa23.79■■□□□ 1.4
P3H1-214ENST00000495874 IGF1RP08069 1367 aa23.78■■□□□ 1.4
P3H1-214ENST00000495874 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
P3H1-214ENST00000495874 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.76■■□□□ 1.39
P3H1-214ENST00000495874 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.76■■□□□ 1.39
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P3H1-214ENST00000495874 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.71■■□□□ 1.39
P3H1-214ENST00000495874 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
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P3H1-214ENST00000495874 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.68■■□□□ 1.38
P3H1-214ENST00000495874 NESP48681 1621 aa23.68■■□□□ 1.38
P3H1-214ENST00000495874 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.63■■□□□ 1.37
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P3H1-214ENST00000495874 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
P3H1-214ENST00000495874 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.58■■□□□ 1.37
P3H1-214ENST00000495874 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
P3H1-214ENST00000495874 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
P3H1-214ENST00000495874 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.52■■□□□ 1.36
P3H1-214ENST00000495874 MIER1Q8N108 512 aa23.51■■□□□ 1.35
P3H1-214ENST00000495874 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
P3H1-214ENST00000495874 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
P3H1-214ENST00000495874 TOPBP1Q92547 1522 aa23.48■■□□□ 1.35
P3H1-214ENST00000495874 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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