RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283882.3

CFDP1-201, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFDP1, Length 1,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-201ENST00000283882 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.01■■■□□ 2.23
CFDP1-201ENST00000283882 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CFDP1-201ENST00000283882 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.95■■□□□ 1.9
CFDP1-201ENST00000283882 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.53■■□□□ 1.68
CFDP1-201ENST00000283882 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CFDP1-201ENST00000283882 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CFDP1-201ENST00000283882 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CFDP1-201ENST00000283882 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.14■■□□□ 1.45
CFDP1-201ENST00000283882 ABCC9O60706 1549 aa24.09■■□□□ 1.45
CFDP1-201ENST00000283882 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.97■■□□□ 1.43
CFDP1-201ENST00000283882 NACADO15069 1562 aa23.79■■□□□ 1.4
CFDP1-201ENST00000283882 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.69■■□□□ 1.38
CFDP1-201ENST00000283882 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.61■■□□□ 1.37
CFDP1-201ENST00000283882 SCRIBQ14160 1630 aa23.24■■□□□ 1.31
CFDP1-201ENST00000283882 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.21■■□□□ 1.31
CFDP1-201ENST00000283882 FOXD1Q16676 465 aa23.06■■□□□ 1.28
CFDP1-201ENST00000283882 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.04■■□□□ 1.28
CFDP1-201ENST00000283882 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.84■■□□□ 1.25
CFDP1-201ENST00000283882 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
CFDP1-201ENST00000283882 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CFDP1-201ENST00000283882 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.45■■□□□ 1.18
CFDP1-201ENST00000283882 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CFDP1-201ENST00000283882 SMARCA4P51532 1647 aa22.35■■□□□ 1.17
CFDP1-201ENST00000283882 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.33■■□□□ 1.16
CFDP1-201ENST00000283882 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CFDP1-201ENST00000283882 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.19■■□□□ 1.14
CFDP1-201ENST00000283882 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CFDP1-201ENST00000283882 WIZO95785 1651 aa22.11■■□□□ 1.13
CFDP1-201ENST00000283882 POTEDQ86YR6 584 aa22.09■■□□□ 1.13
CFDP1-201ENST00000283882 SMARCA2P51531 1590 aa22.08■■□□□ 1.12
CFDP1-201ENST00000283882 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.03■■□□□ 1.12
CFDP1-201ENST00000283882 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CFDP1-201ENST00000283882 HMGXB3Q12766 1538 aa21.93■■□□□ 1.1
CFDP1-201ENST00000283882 NCAPD3P42695 1498 aa21.92■■□□□ 1.1
CFDP1-201ENST00000283882 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CFDP1-201ENST00000283882 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.88■■□□□ 1.09
CFDP1-201ENST00000283882 MSH5O43196 834 aa21.78■■□□□ 1.08
CFDP1-201ENST00000283882 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.68■■□□□ 1.06
CFDP1-201ENST00000283882 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CFDP1-201ENST00000283882 CFTRP13569 1480 aa21.35■■□□□ 1.01
CFDP1-201ENST00000283882 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.35■■□□□ 1.01
CFDP1-201ENST00000283882 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.29■■□□□ 1
CFDP1-201ENST00000283882 PRDM2Q13029 1718 aa21.29■■□□□ 1
CFDP1-201ENST00000283882 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.28■■□□□ 1
CFDP1-201ENST00000283882 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.23■□□□□ 0.99
CFDP1-201ENST00000283882 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.19■□□□□ 0.98
CFDP1-201ENST00000283882 ADRA2BP18089 450 aa21.08■□□□□ 0.97
CFDP1-201ENST00000283882 ABCC8Q09428 1581 aa21.08■□□□□ 0.97
CFDP1-201ENST00000283882 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
CFDP1-201ENST00000283882 NESP48681 1621 aa21.07■□□□□ 0.96
CFDP1-201ENST00000283882 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.04■□□□□ 0.96
CFDP1-201ENST00000283882 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.04■□□□□ 0.96
CFDP1-201ENST00000283882 TRIM41Q8WV44 630 aa21■□□□□ 0.95
CFDP1-201ENST00000283882 TOP2BQ02880 1626 aa20.98■□□□□ 0.95
CFDP1-201ENST00000283882 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.98■□□□□ 0.95
CFDP1-201ENST00000283882 SYNJ1O43426 1573 aa20.97■□□□□ 0.95
CFDP1-201ENST00000283882 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.96■□□□□ 0.95
CFDP1-201ENST00000283882 CUX1P39880 1505 aa20.92■□□□□ 0.94
CFDP1-201ENST00000283882 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.89■□□□□ 0.93
CFDP1-201ENST00000283882 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.88■□□□□ 0.93
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CFDP1-201ENST00000283882 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CFDP1-201ENST00000283882 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.78■□□□□ 0.92
CFDP1-201ENST00000283882 EEA1Q15075 1411 aa20.76■□□□□ 0.91
CFDP1-201ENST00000283882 ERCC6Q03468 1493 aa20.73■□□□□ 0.91
CFDP1-201ENST00000283882 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.72■□□□□ 0.91
CFDP1-201ENST00000283882 WDR62O43379 1518 aa20.71■□□□□ 0.91
CFDP1-201ENST00000283882 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CFDP1-201ENST00000283882 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CFDP1-201ENST00000283882 SOGA1O94964 1423 aa20.63■□□□□ 0.89
CFDP1-201ENST00000283882 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.61■□□□□ 0.89
CFDP1-201ENST00000283882 WDR97A6NE52 1622 aa20.58■□□□□ 0.89
CFDP1-201ENST00000283882 KIF27Q86VH2 1401 aa20.58■□□□□ 0.88
CFDP1-201ENST00000283882 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.53■□□□□ 0.88
CFDP1-201ENST00000283882 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CFDP1-201ENST00000283882 CUX2O14529 1486 aa20.52■□□□□ 0.88
CFDP1-201ENST00000283882 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.51■□□□□ 0.87
CFDP1-201ENST00000283882 IFT140Q96RY7 1462 aa20.5■□□□□ 0.87
CFDP1-201ENST00000283882 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.48■□□□□ 0.87
CFDP1-201ENST00000283882 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.47■□□□□ 0.87
CFDP1-201ENST00000283882 KIF21BO75037 1637 aa20.46■□□□□ 0.87
CFDP1-201ENST00000283882 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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CFDP1-201ENST00000283882 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.39■□□□□ 0.85
CFDP1-201ENST00000283882 GOLGA3Q08378 1498 aa20.37■□□□□ 0.85
CFDP1-201ENST00000283882 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.37■□□□□ 0.85
CFDP1-201ENST00000283882 IGF1RP08069 1367 aa20.36■□□□□ 0.85
CFDP1-201ENST00000283882 CUL7Q14999 1698 aa20.35■□□□□ 0.85
CFDP1-201ENST00000283882 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CFDP1-201ENST00000283882 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CFDP1-201ENST00000283882 PBRM1Q86U86 1689 aa20.29■□□□□ 0.84
CFDP1-201ENST00000283882 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.29■□□□□ 0.84
CFDP1-201ENST00000283882 GRIN2BQ13224 1484 aa20.29■□□□□ 0.84
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CFDP1-201ENST00000283882 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.27■□□□□ 0.84
CFDP1-201ENST00000283882 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.26■□□□□ 0.83
CFDP1-201ENST00000283882 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.25■□□□□ 0.83
CFDP1-201ENST00000283882 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.838e-9■□□□□ 9.4
CFDP1-201ENST00000283882 ADAMTS12P58397 1594 aa20.21■□□□□ 0.83
CFDP1-201ENST00000283882 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.19■□□□□ 0.82
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