RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460031.5

P3H1-207, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene P3H1, Length 2,726 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-207ENST00000460031 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.3■■■■□ 3.24
P3H1-207ENST00000460031 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.52■■■□□ 2.48
P3H1-207ENST00000460031 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
P3H1-207ENST00000460031 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.85■■■□□ 2.37
P3H1-207ENST00000460031 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
P3H1-207ENST00000460031 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.78■■■□□ 2.36
P3H1-207ENST00000460031 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.84■■■□□ 2.21
P3H1-207ENST00000460031 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.78■■■□□ 2.2
P3H1-207ENST00000460031 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.75■■■□□ 2.19
P3H1-207ENST00000460031 SCRIBQ14160 1630 aa28.32■■■□□ 2.12
P3H1-207ENST00000460031 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.17■■■□□ 2.1
P3H1-207ENST00000460031 ABCC9O60706 1549 aa28.16■■■□□ 2.1
P3H1-207ENST00000460031 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.07■■■□□ 2.08
P3H1-207ENST00000460031 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
P3H1-207ENST00000460031 HRCP23327 699 aa27.86■■■□□ 2.05
P3H1-207ENST00000460031 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.77■■■□□ 2.04
P3H1-207ENST00000460031 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.72■■■□□ 2.03
P3H1-207ENST00000460031 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
P3H1-207ENST00000460031 TRIM41Q8WV44 630 aa27.69■■■□□ 2.02
P3H1-207ENST00000460031 NACADO15069 1562 aa27.67■■■□□ 2.02
P3H1-207ENST00000460031 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.65■■■□□ 2.02
P3H1-207ENST00000460031 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
P3H1-207ENST00000460031 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.56■■■□□ 2
P3H1-207ENST00000460031 WIZO95785 1651 aa27.42■■□□□ 1.98
P3H1-207ENST00000460031 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
P3H1-207ENST00000460031 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
P3H1-207ENST00000460031 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.912e-6■□□□□ 11
P3H1-207ENST00000460031 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.94■■□□□ 1.9
P3H1-207ENST00000460031 SMARCA4P51532 1647 aa26.9■■□□□ 1.9
P3H1-207ENST00000460031 ABCC8Q09428 1581 aa26.88■■□□□ 1.89
P3H1-207ENST00000460031 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
P3H1-207ENST00000460031 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.85■■□□□ 1.89
P3H1-207ENST00000460031 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
P3H1-207ENST00000460031 SMARCA2P51531 1590 aa26.75■■□□□ 1.87
P3H1-207ENST00000460031 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
P3H1-207ENST00000460031 SOGA1O94964 1423 aa26.62■■□□□ 1.85
P3H1-207ENST00000460031 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.6■■□□□ 1.85
P3H1-207ENST00000460031 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
P3H1-207ENST00000460031 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.52■■□□□ 1.84
P3H1-207ENST00000460031 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
P3H1-207ENST00000460031 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
P3H1-207ENST00000460031 CEP162Q5TB80 1403 aa26.42■■□□□ 1.82
P3H1-207ENST00000460031 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.4■■□□□ 1.82
P3H1-207ENST00000460031 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
P3H1-207ENST00000460031 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
P3H1-207ENST00000460031 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.27■■□□□ 1.8
P3H1-207ENST00000460031 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.25■■□□□ 1.79
P3H1-207ENST00000460031 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.23■■□□□ 1.79
P3H1-207ENST00000460031 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
P3H1-207ENST00000460031 SYNJ1O43426 1573 aa26.2■■□□□ 1.79
P3H1-207ENST00000460031 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
P3H1-207ENST00000460031 EEA1Q15075 1411 aa26.19■■□□□ 1.78
P3H1-207ENST00000460031 GOLGA3Q08378 1498 aa26.15■■□□□ 1.78
P3H1-207ENST00000460031 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.98■■□□□ 1.75
P3H1-207ENST00000460031 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.93■■□□□ 1.74
P3H1-207ENST00000460031 CLIP1P30622 1438 aa25.93■■□□□ 1.74
P3H1-207ENST00000460031 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
P3H1-207ENST00000460031 KIF21BO75037 1637 aa25.87■■□□□ 1.73
P3H1-207ENST00000460031 TOP2BQ02880 1626 aa25.77■■□□□ 1.72
P3H1-207ENST00000460031 APLP2Q06481 763 aa25.77■■□□□ 1.72
P3H1-207ENST00000460031 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
P3H1-207ENST00000460031 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.74■■□□□ 1.71
P3H1-207ENST00000460031 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
P3H1-207ENST00000460031 NCAPD3P42695 1498 aa25.66■■□□□ 1.7
P3H1-207ENST00000460031 CUX1P39880 1505 aa25.63■■□□□ 1.69
P3H1-207ENST00000460031 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.62■■□□□ 1.69
P3H1-207ENST00000460031 HMGXB3Q12766 1538 aa25.6■■□□□ 1.69
P3H1-207ENST00000460031 PRXQ9BXM0 1461 aa25.54■■□□□ 1.68
P3H1-207ENST00000460031 NEUROD1Q13562 356 aa25.51■■□□□ 1.67
P3H1-207ENST00000460031 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
P3H1-207ENST00000460031 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
P3H1-207ENST00000460031 CFTRP13569 1480 aa25.49■■□□□ 1.67
P3H1-207ENST00000460031 KIF27Q86VH2 1401 aa25.48■■□□□ 1.67
P3H1-207ENST00000460031 ARAP1Q96P48 1450 aa25.48■■□□□ 1.67
P3H1-207ENST00000460031 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.45■■□□□ 1.66
P3H1-207ENST00000460031 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
P3H1-207ENST00000460031 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
P3H1-207ENST00000460031 CUX2O14529 1486 aa25.33■■□□□ 1.65
P3H1-207ENST00000460031 ITGAEP38570 1179 aa25.33■■□□□ 1.64
P3H1-207ENST00000460031 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.3■■□□□ 1.64
P3H1-207ENST00000460031 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.27■■□□□ 1.64
P3H1-207ENST00000460031 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.26■■□□□ 1.63
P3H1-207ENST00000460031 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
P3H1-207ENST00000460031 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.25■■□□□ 1.63
P3H1-207ENST00000460031 IGF1RP08069 1367 aa25.24■■□□□ 1.63
P3H1-207ENST00000460031 MIER1Q8N108 512 aa25.24■■□□□ 1.63
P3H1-207ENST00000460031 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.21■■□□□ 1.63
P3H1-207ENST00000460031 P3H3Q8IVL6 736 aa25.2■■□□□ 1.62
P3H1-207ENST00000460031 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
P3H1-207ENST00000460031 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.15■■□□□ 1.62
P3H1-207ENST00000460031 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
P3H1-207ENST00000460031 PRDM2Q13029 1718 aa25.14■■□□□ 1.61
P3H1-207ENST00000460031 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.09■■□□□ 1.61
P3H1-207ENST00000460031 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
P3H1-207ENST00000460031 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.06■■□□□ 1.6
P3H1-207ENST00000460031 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.05■■□□□ 1.6
P3H1-207ENST00000460031 NESP48681 1621 aa25.03■■□□□ 1.6
P3H1-207ENST00000460031 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.03■■□□□ 1.6
P3H1-207ENST00000460031 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
P3H1-207ENST00000460031 TIAM1Q13009 1591 aa24.93■■□□□ 1.58
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