RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480062.5

ARPC2-214, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene ARPC2, Length 508 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytosol, Lamellipodium, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC2-214ENST00000480062 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.81■■■■■ 7.81
ARPC2-214ENST00000480062 ABCC9O60706 1549 aa57.11■■■■■ 6.73
ARPC2-214ENST00000480062 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.03■■■■■ 6.72
ARPC2-214ENST00000480062 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.24■■■■■ 6.27
ARPC2-214ENST00000480062 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.95■■■■■ 6.23
ARPC2-214ENST00000480062 NACADO15069 1562 aa53.91■■■■■ 6.22
ARPC2-214ENST00000480062 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.54■■■■■ 6.16
ARPC2-214ENST00000480062 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.3■■■■■ 6.12
ARPC2-214ENST00000480062 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.15■■■■■ 6.1
ARPC2-214ENST00000480062 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.1■■■■■ 6.09
ARPC2-214ENST00000480062 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.92■■■■■ 6.06
ARPC2-214ENST00000480062 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.8■■■■■ 6.04
ARPC2-214ENST00000480062 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.59■■■■■ 6.01
ARPC2-214ENST00000480062 SCRIBQ14160 1630 aa52.19■■■■■ 5.95
ARPC2-214ENST00000480062 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.83■■■■■ 5.89
ARPC2-214ENST00000480062 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.51■■■■■ 5.84
ARPC2-214ENST00000480062 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.43■■■■■ 5.82
ARPC2-214ENST00000480062 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.35■■■■■ 5.81
ARPC2-214ENST00000480062 NCAPD3P42695 1498 aa49.82■■■■■ 5.57
ARPC2-214ENST00000480062 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.76■■■■■ 5.56
ARPC2-214ENST00000480062 SMARCA4P51532 1647 aa49.73■■■■■ 5.55
ARPC2-214ENST00000480062 SMARCA2P51531 1590 aa49.52■■■■■ 5.52
ARPC2-214ENST00000480062 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.45■■■■■ 5.51
ARPC2-214ENST00000480062 HMGXB3Q12766 1538 aa49.42■■■■■ 5.5
ARPC2-214ENST00000480062 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.27■■■■■ 5.48
ARPC2-214ENST00000480062 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.25■■■■■ 5.48
ARPC2-214ENST00000480062 ERCC6Q03468 1493 aa49.19■■■■■ 5.47
ARPC2-214ENST00000480062 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.16■■■■■ 5.46
ARPC2-214ENST00000480062 NESP48681 1621 aa49.16■■■■■ 5.46
ARPC2-214ENST00000480062 CUX2O14529 1486 aa48.94■■■■■ 5.43
ARPC2-214ENST00000480062 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.83■■■■■ 5.41
ARPC2-214ENST00000480062 WIZO95785 1651 aa48.66■■■■■ 5.38
ARPC2-214ENST00000480062 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.6■■■■■ 5.37
ARPC2-214ENST00000480062 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
ARPC2-214ENST00000480062 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.41■■■■■ 5.34
ARPC2-214ENST00000480062 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.35■■■■■ 5.33
ARPC2-214ENST00000480062 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.35■■■■■ 5.33
ARPC2-214ENST00000480062 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.3■■■■■ 5.32
ARPC2-214ENST00000480062 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.97■■■■■ 5.27
ARPC2-214ENST00000480062 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
ARPC2-214ENST00000480062 WDR62O43379 1518 aa47.83■■■■■ 5.25
ARPC2-214ENST00000480062 CFTRP13569 1480 aa47.83■■■■■ 5.25
ARPC2-214ENST00000480062 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.83■■■■■ 5.25
ARPC2-214ENST00000480062 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.81■■■■■ 5.24
ARPC2-214ENST00000480062 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.53■■■■■ 5.2
ARPC2-214ENST00000480062 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
ARPC2-214ENST00000480062 PRDM2Q13029 1718 aa47.24■■■■■ 5.15
ARPC2-214ENST00000480062 TOPBP1Q92547 1522 aa46.95■■■■■ 5.11
ARPC2-214ENST00000480062 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.9■■■■■ 5.1
ARPC2-214ENST00000480062 TRIM41Q8WV44 630 aa46.89■■■■■ 5.1
ARPC2-214ENST00000480062 IFT140Q96RY7 1462 aa46.83■■■■■ 5.09
ARPC2-214ENST00000480062 OSCARQ8IYS5 282 aa46.83■■■■■ 5.09
ARPC2-214ENST00000480062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.73■■■■■ 5.07
ARPC2-214ENST00000480062 ABCC8Q09428 1581 aa46.69■■■■■ 5.06
ARPC2-214ENST00000480062 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
ARPC2-214ENST00000480062 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.04
ARPC2-214ENST00000480062 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.5■■■■■ 5.032e-9■■■□□ 15.7
ARPC2-214ENST00000480062 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
ARPC2-214ENST00000480062 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
ARPC2-214ENST00000480062 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.41■■■■■ 5.02
ARPC2-214ENST00000480062 SOGA1O94964 1423 aa46.28■■■■■ 5
ARPC2-214ENST00000480062 CUX1P39880 1505 aa46.26■■■■■ 5
ARPC2-214ENST00000480062 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.25■■■■■ 4.99
ARPC2-214ENST00000480062 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.24■■■■■ 4.99
ARPC2-214ENST00000480062 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.23■■■■■ 4.99
ARPC2-214ENST00000480062 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.23■■■■■ 4.99
ARPC2-214ENST00000480062 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.23■■■■■ 4.99
ARPC2-214ENST00000480062 FBLN2P98095 1184 aa46.16■■■■■ 4.98
ARPC2-214ENST00000480062 CHD1O14646 1710 aa46.16■■■■■ 4.98
ARPC2-214ENST00000480062 ARHGEF11O15085 1522 aa46.1■■■■■ 4.97
ARPC2-214ENST00000480062 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.97■■■■■ 4.95
ARPC2-214ENST00000480062 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.84■■■■■ 4.93
ARPC2-214ENST00000480062 WDR97A6NE52 1622 aa45.84■■■■■ 4.93
ARPC2-214ENST00000480062 GRIN2BQ13224 1484 aa45.8■■■■■ 4.92
ARPC2-214ENST00000480062 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.76■■■■■ 4.92
ARPC2-214ENST00000480062 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
ARPC2-214ENST00000480062 ARAP1Q96P48 1450 aa45.7■■■■■ 4.91
ARPC2-214ENST00000480062 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.69■■■■■ 4.91
ARPC2-214ENST00000480062 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.66■■■■■ 4.9
ARPC2-214ENST00000480062 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.63■■■■■ 4.9
ARPC2-214ENST00000480062 SYNJ2O15056 1496 aa45.62■■■■■ 4.89
ARPC2-214ENST00000480062 PBRM1Q86U86 1689 aa45.62■■■■■ 4.89
ARPC2-214ENST00000480062 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.59■■■■■ 4.89
ARPC2-214ENST00000480062 SYNJ1O43426 1573 aa45.54■■■■■ 4.88
ARPC2-214ENST00000480062 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.52■■■■■ 4.88
ARPC2-214ENST00000480062 TOP2BQ02880 1626 aa45.47■■■■■ 4.87
ARPC2-214ENST00000480062 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.45■■■■■ 4.87
ARPC2-214ENST00000480062 ADAMTS12P58397 1594 aa45.24■■■■■ 4.83
ARPC2-214ENST00000480062 GRIN2AQ12879 1464 aa45.23■■■■■ 4.83
ARPC2-214ENST00000480062 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
ARPC2-214ENST00000480062 CEP170Q5SW79 1584 aa45.11■■■■■ 4.81
ARPC2-214ENST00000480062 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.09■■■■■ 4.81
ARPC2-214ENST00000480062 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.08■■■■■ 4.81
ARPC2-214ENST00000480062 NUP160Q12769 1436 aa45.07■■■■■ 4.81
ARPC2-214ENST00000480062 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.04■■■■■ 4.8
ARPC2-214ENST00000480062 SHROOM2Q13796 1616 aa44.82■■■■■ 4.77
ARPC2-214ENST00000480062 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
ARPC2-214ENST00000480062 JPH4Q96JJ6 628 aa44.66■■■■■ 4.74
ARPC2-214ENST00000480062 IGF1RP08069 1367 aa44.65■■■■■ 4.74
ARPC2-214ENST00000480062 KIF27Q86VH2 1401 aa44.59■■■■■ 4.73
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