Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.228e-31■■■■■ 129.7
RBM22Q9NW64 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.222e-34■■■■■ 120.8
RBM22Q9NW64 GGT7-204ENST00000470952 427 ntTSL 514.86□□□□□ -0.033e-56■■■■■ 118.7
RBM22Q9NW64 GGT7-203ENST00000469018 1064 ntTSL 514.86□□□□□ -0.033e-56■■■■■ 118.7
RBM22Q9NW64 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-20■■■■■ 107.6
RBM22Q9NW64 YARS-209ENST00000490826 2178 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-20■■■■■ 107.6
RBM22Q9NW64 YARS-206ENST00000478828 1044 ntTSL 211.1□□□□□ -0.632e-20■■■■■ 107.6
RBM22Q9NW64 YARS-203ENST00000469100 2247 ntTSL 211□□□□□ -0.652e-20■■■■■ 107.6
RBM22Q9NW64 YARS-208ENST00000487404 2197 ntTSL 210.69□□□□□ -0.72e-20■■■■■ 107.6
RBM22Q9NW64 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.822e-41■■■■■ 104.9
RBM22Q9NW64 CARS2-219ENST00000539405 1041 ntTSL 312.22□□□□□ -0.459e-20■■■■■ 104.4
RBM22Q9NW64 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 35.85□□□□□ -1.479e-20■■■■■ 104.4
RBM22Q9NW64 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 32.82□□□□□ -1.969e-20■■■■■ 104.4
RBM22Q9NW64 UFD1-206ENST00000466373 3059 ntTSL 210.57□□□□□ -0.722e-16■■■■■ 103.6
RBM22Q9NW64 A2M-210ENST00000542567 563 ntTSL 46.99□□□□□ -1.294e-19■■■■■ 101.3
RBM22Q9NW64 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.384e-13■■■■■ 100.7
RBM22Q9NW64 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.581e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-221ENST00000514588 490 ntTSL 423.94■■□□□ 1.421e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.421e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.381e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-209ENST00000505884 592 ntTSL 418.23■□□□□ 0.511e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-219ENST00000513956 562 ntTSL 218.23■□□□□ 0.511e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-214ENST00000511161 579 ntTSL 418.23■□□□□ 0.511e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-211ENST00000508143 574 ntTSL 418.23■□□□□ 0.511e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-208ENST00000505672 932 ntTSL 217.97■□□□□ 0.471e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-217ENST00000512381 432 ntTSL 317.7■□□□□ 0.421e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.311e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-216ENST00000511686 576 ntTSL 315.35■□□□□ 0.051e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-206ENST00000502771 544 ntTSL 415.28■□□□□ 0.041e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-220ENST00000514382 476 ntTSL 413.3□□□□□ -0.281e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.951e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.196e-13■■■■■ 97.1
RBM22Q9NW64 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.436e-13■■■■■ 97.1
RBM22Q9NW64 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.226e-13■■■■■ 97.1
RBM22Q9NW64 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.534e-18■■■■■ 95.2
RBM22Q9NW64 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.534e-18■■■■■ 95.2
RBM22Q9NW64 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.824e-18■■■■■ 95.2
RBM22Q9NW64 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.05□□□□□ -0.169e-19■■■■■ 91.8
RBM22Q9NW64 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.32□□□□□ -0.69e-19■■■■■ 91.8
RBM22Q9NW64 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.24□□□□□ -0.619e-19■■■■■ 91.8
RBM22Q9NW64 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.221e-323■■■■■ 91.2
RBM22Q9NW64 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-12■■■■■ 89.1
RBM22Q9NW64 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.342e-40■■■■■ 87.8
RBM22Q9NW64 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 86.2
RBM22Q9NW64 PCSK9-202ENST00000490692 3891 ntTSL 211.47□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 86.2
RBM22Q9NW64 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.084e-16■■■■■ 85.5
RBM22Q9NW64 ABHD4-206ENST00000539344 986 ntTSL 214.54□□□□□ -0.084e-16■■■■■ 85.5
RBM22Q9NW64 ABHD4-208ENST00000542041 465 ntTSL 414.54□□□□□ -0.084e-16■■■■■ 85.5
RBM22Q9NW64 ABHD4-209ENST00000544562 929 ntTSL 211.07□□□□□ -0.644e-16■■■■■ 85.5
RBM22Q9NW64 ABHD4-202ENST00000418446 1003 ntTSL 210.93□□□□□ -0.664e-16■■■■■ 85.5
RBM22Q9NW64 ABHD4-205ENST00000537243 550 ntTSL 510.74□□□□□ -0.694e-16■■■■■ 85.5
RBM22Q9NW64 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.014e-16■■■■■ 85.5
RBM22Q9NW64 NUP214-216ENST00000526346 577 ntTSL 46.21□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 85
RBM22Q9NW64 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.696e-7■■■■■ 83.9
RBM22Q9NW64 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.476e-7■■■■■ 83.9
RBM22Q9NW64 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.214e-19■■■■■ 82.8
RBM22Q9NW64 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.214e-19■■■■■ 82.8
RBM22Q9NW64 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.214e-19■■■■■ 82.8
RBM22Q9NW64 PPIA-209ENST00000494484 2149 ntTSL 211.3□□□□□ -0.64e-19■■■■■ 82.8
RBM22Q9NW64 PPIA-205ENST00000479021 552 ntTSL 410.66□□□□□ -0.74e-19■■■■■ 82.8
RBM22Q9NW64 PPIA-202ENST00000415933 863 ntTSL 28.82□□□□□ -14e-19■■■■■ 82.8
RBM22Q9NW64 PPIA-206ENST00000480603 842 ntTSL 38.8□□□□□ -14e-19■■■■■ 82.8
RBM22Q9NW64 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.174e-19■■■■■ 82.8
RBM22Q9NW64 PPIA-207ENST00000481437 570 ntTSL 26.15□□□□□ -1.424e-19■■■■■ 82.8
RBM22Q9NW64 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.444e-19■■■■■ 82.8
RBM22Q9NW64 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-16■■■■■ 82.1
RBM22Q9NW64 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.832e-16■■■■■ 82.1
RBM22Q9NW64 TXNIP-202ENST00000486597 509 ntTSL 24.81□□□□□ -1.642e-17■■■■■ 80
RBM22Q9NW64 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.013e-12■■■■■ 79.9
RBM22Q9NW64 TAF1D-209ENST00000528734 664 ntTSL 20.62□□□□□ -2.313e-12■■■■■ 79.9
RBM22Q9NW64 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.182e-13■■■■■ 79.6
RBM22Q9NW64 SF1-221ENST00000633899 591 ntTSL 421.03■□□□□ 0.962e-13■■■■■ 79.6
RBM22Q9NW64 SF1-213ENST00000472725 632 ntTSL 320.25■□□□□ 0.831e-14■■■■■ 79.6
RBM22Q9NW64 SF1-212ENST00000463343 983 ntTSL 217.9■□□□□ 0.462e-13■■■■■ 79.6
RBM22Q9NW64 SF1-215ENST00000482693 755 ntTSL 216.96■□□□□ 0.312e-13■■■■■ 79.6
RBM22Q9NW64 SF1-207ENST00000413951 623 ntTSL 216.59■□□□□ 0.252e-13■■■■■ 79.6
RBM22Q9NW64 SF1-208ENST00000432725 475 ntTSL 415.84■□□□□ 0.131e-14■■■■■ 79.6
RBM22Q9NW64 ANAPC5-206ENST00000535463 265 ntTSL 310.43□□□□□ -0.744e-18■■■■■ 79.5
RBM22Q9NW64 ANAPC5-208ENST00000535482 2077 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.034e-18■■■■■ 79.5
RBM22Q9NW64 ANAPC5-213ENST00000538334 6149 ntTSL 57.75□□□□□ -1.174e-18■■■■■ 79.5
RBM22Q9NW64 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 319.03■□□□□ 0.643e-14■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 519.03■□□□□ 0.643e-14■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 518.99■□□□□ 0.633e-14■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 318.45■□□□□ 0.543e-14■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.163e-14■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 515.98■□□□□ 0.152e-15■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.962e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.712e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.472e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 517.31■□□□□ 0.362e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.192e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 214.06□□□□□ -0.162e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.422e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 LRIG2-203ENST00000466161 3366 ntTSL 26.13□□□□□ -1.432e-13■■■■■ 75.2
RBM22Q9NW64 RPS25-204ENST00000527853 1462 ntTSL 218.18■□□□□ 0.56e-13■■■■■ 75.1
RBM22Q9NW64 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.36e-13■■■■■ 75.1
RBM22Q9NW64 RPS25-203ENST00000527791 711 ntTSL 212.89□□□□□ -0.356e-13■■■■■ 75.1
RBM22Q9NW64 RPS25-206ENST00000532567 508 ntTSL 25.49□□□□□ -1.536e-13■■■■■ 75.1
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 80.5 ms