Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.228e-31■■■■■ 129.7
RBM22Q9NW64 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.222e-34■■■■■ 120.8
RBM22Q9NW64 GGT7-204ENST00000470952 427 ntTSL 514.86□□□□□ -0.033e-56■■■■■ 118.7
RBM22Q9NW64 GGT7-203ENST00000469018 1064 ntTSL 514.86□□□□□ -0.033e-56■■■■■ 118.7
RBM22Q9NW64 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-20■■■■■ 107.6
RBM22Q9NW64 YARS-209ENST00000490826 2178 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-20■■■■■ 107.6
RBM22Q9NW64 YARS-206ENST00000478828 1044 ntTSL 211.1□□□□□ -0.632e-20■■■■■ 107.6
RBM22Q9NW64 YARS-203ENST00000469100 2247 ntTSL 211□□□□□ -0.652e-20■■■■■ 107.6
RBM22Q9NW64 YARS-208ENST00000487404 2197 ntTSL 210.69□□□□□ -0.72e-20■■■■■ 107.6
RBM22Q9NW64 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.822e-41■■■■■ 104.9
RBM22Q9NW64 CARS2-219ENST00000539405 1041 ntTSL 312.22□□□□□ -0.459e-20■■■■■ 104.4
RBM22Q9NW64 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 35.85□□□□□ -1.479e-20■■■■■ 104.4
RBM22Q9NW64 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 32.82□□□□□ -1.969e-20■■■■■ 104.4
RBM22Q9NW64 UFD1-206ENST00000466373 3059 ntTSL 210.57□□□□□ -0.722e-16■■■■■ 103.6
RBM22Q9NW64 A2M-210ENST00000542567 563 ntTSL 46.99□□□□□ -1.294e-19■■■■■ 101.3
RBM22Q9NW64 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.384e-13■■■■■ 100.7
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RBM22Q9NW64 CCND3-221ENST00000514588 490 ntTSL 423.94■■□□□ 1.421e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.421e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.381e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-209ENST00000505884 592 ntTSL 418.23■□□□□ 0.511e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-219ENST00000513956 562 ntTSL 218.23■□□□□ 0.511e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-214ENST00000511161 579 ntTSL 418.23■□□□□ 0.511e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-211ENST00000508143 574 ntTSL 418.23■□□□□ 0.511e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-208ENST00000505672 932 ntTSL 217.97■□□□□ 0.471e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-217ENST00000512381 432 ntTSL 317.7■□□□□ 0.421e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.311e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-216ENST00000511686 576 ntTSL 315.35■□□□□ 0.051e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-206ENST00000502771 544 ntTSL 415.28■□□□□ 0.041e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 CCND3-220ENST00000514382 476 ntTSL 413.3□□□□□ -0.281e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.951e-25■■■■■ 100.1
RBM22Q9NW64 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.196e-13■■■■■ 97.1
RBM22Q9NW64 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.436e-13■■■■■ 97.1
RBM22Q9NW64 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.226e-13■■■■■ 97.1
RBM22Q9NW64 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.534e-18■■■■■ 95.2
RBM22Q9NW64 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.534e-18■■■■■ 95.2
RBM22Q9NW64 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.824e-18■■■■■ 95.2
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RBM22Q9NW64 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.24□□□□□ -0.619e-19■■■■■ 91.8
RBM22Q9NW64 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.221e-323■■■■■ 91.2
RBM22Q9NW64 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-12■■■■■ 89.1
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RBM22Q9NW64 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 86.2
RBM22Q9NW64 PCSK9-202ENST00000490692 3891 ntTSL 211.47□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 86.2
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RBM22Q9NW64 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.014e-16■■■■■ 85.5
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RBM22Q9NW64 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.476e-7■■■■■ 83.9
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RBM22Q9NW64 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.174e-19■■■■■ 82.8
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RBM22Q9NW64 TXNIP-202ENST00000486597 509 ntTSL 24.81□□□□□ -1.642e-17■■■■■ 80
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RBM22Q9NW64 ANAPC5-208ENST00000535482 2077 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.034e-18■■■■■ 79.5
RBM22Q9NW64 ANAPC5-213ENST00000538334 6149 ntTSL 57.75□□□□□ -1.174e-18■■■■■ 79.5
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RBM22Q9NW64 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 519.03■□□□□ 0.643e-14■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 518.99■□□□□ 0.633e-14■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 318.45■□□□□ 0.543e-14■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.163e-14■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 515.98■□□□□ 0.152e-15■■■■■ 76
RBM22Q9NW64 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.962e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.712e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.472e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 517.31■□□□□ 0.362e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.192e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 214.06□□□□□ -0.162e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.422e-16■■■■■ 75.9
RBM22Q9NW64 LRIG2-203ENST00000466161 3366 ntTSL 26.13□□□□□ -1.432e-13■■■■■ 75.2
RBM22Q9NW64 RPS25-204ENST00000527853 1462 ntTSL 218.18■□□□□ 0.56e-13■■■■■ 75.1
RBM22Q9NW64 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.36e-13■■■■■ 75.1
RBM22Q9NW64 RPS25-203ENST00000527791 711 ntTSL 212.89□□□□□ -0.356e-13■■■■■ 75.1
RBM22Q9NW64 RPS25-206ENST00000532567 508 ntTSL 25.49□□□□□ -1.536e-13■■■■■ 75.1
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