RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472802.1

P3H1-211, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene P3H1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-211ENST00000472802 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.2■■■■□ 3.23
P3H1-211ENST00000472802 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.5■■■□□ 2.63
P3H1-211ENST00000472802 ABCC9O60706 1549 aa31.46■■■□□ 2.63
P3H1-211ENST00000472802 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.94■■■□□ 2.38
P3H1-211ENST00000472802 NACADO15069 1562 aa29.77■■■□□ 2.36
P3H1-211ENST00000472802 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.67■■■□□ 2.34
P3H1-211ENST00000472802 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.58■■■□□ 2.33
P3H1-211ENST00000472802 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.4■■■□□ 2.3
P3H1-211ENST00000472802 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.38■■■□□ 2.29
P3H1-211ENST00000472802 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.292e-6■□□□□ 10.5
P3H1-211ENST00000472802 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.17■■■□□ 2.26
P3H1-211ENST00000472802 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
P3H1-211ENST00000472802 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.04■■■□□ 2.24
P3H1-211ENST00000472802 SCRIBQ14160 1630 aa28.73■■■□□ 2.19
P3H1-211ENST00000472802 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.63■■■□□ 2.17
P3H1-211ENST00000472802 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.43■■■□□ 2.14
P3H1-211ENST00000472802 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
P3H1-211ENST00000472802 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.32■■■□□ 2.12
P3H1-211ENST00000472802 NCAPD3P42695 1498 aa27.51■■■□□ 2
P3H1-211ENST00000472802 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.44■■□□□ 1.98
P3H1-211ENST00000472802 SMARCA4P51532 1647 aa27.43■■□□□ 1.98
P3H1-211ENST00000472802 SMARCA2P51531 1590 aa27.32■■□□□ 1.96
P3H1-211ENST00000472802 HMGXB3Q12766 1538 aa27.27■■□□□ 1.96
P3H1-211ENST00000472802 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
P3H1-211ENST00000472802 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.16■■□□□ 1.94
P3H1-211ENST00000472802 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.15■■□□□ 1.94
P3H1-211ENST00000472802 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
P3H1-211ENST00000472802 NESP48681 1621 aa27.1■■□□□ 1.93
P3H1-211ENST00000472802 ERCC6Q03468 1493 aa27.09■■□□□ 1.93
P3H1-211ENST00000472802 CUX2O14529 1486 aa27.03■■□□□ 1.92
P3H1-211ENST00000472802 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.01■■□□□ 1.91
P3H1-211ENST00000472802 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.84■■□□□ 1.89
P3H1-211ENST00000472802 WIZO95785 1651 aa26.84■■□□□ 1.89
P3H1-211ENST00000472802 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
P3H1-211ENST00000472802 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.74■■□□□ 1.87
P3H1-211ENST00000472802 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.68■■□□□ 1.86
P3H1-211ENST00000472802 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.67■■□□□ 1.86
P3H1-211ENST00000472802 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
P3H1-211ENST00000472802 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.44■■□□□ 1.82
P3H1-211ENST00000472802 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
P3H1-211ENST00000472802 WDR62O43379 1518 aa26.39■■□□□ 1.82
P3H1-211ENST00000472802 CFTRP13569 1480 aa26.39■■□□□ 1.82
P3H1-211ENST00000472802 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.36■■□□□ 1.81
P3H1-211ENST00000472802 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.35■■□□□ 1.81
P3H1-211ENST00000472802 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.19■■□□□ 1.78
P3H1-211ENST00000472802 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
P3H1-211ENST00000472802 PRDM2Q13029 1718 aa26.14■■□□□ 1.78
P3H1-211ENST00000472802 TOPBP1Q92547 1522 aa25.88■■□□□ 1.73
P3H1-211ENST00000472802 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
P3H1-211ENST00000472802 OSCARQ8IYS5 282 aa25.85■■□□□ 1.73
P3H1-211ENST00000472802 TRIM41Q8WV44 630 aa25.82■■□□□ 1.72
P3H1-211ENST00000472802 IFT140Q96RY7 1462 aa25.82■■□□□ 1.72
P3H1-211ENST00000472802 ABCC8Q09428 1581 aa25.78■■□□□ 1.72
P3H1-211ENST00000472802 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.77■■□□□ 1.72
P3H1-211ENST00000472802 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
P3H1-211ENST00000472802 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
P3H1-211ENST00000472802 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.694e-8■■■□□ 17.5
P3H1-211ENST00000472802 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
P3H1-211ENST00000472802 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.56■■□□□ 1.68
P3H1-211ENST00000472802 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.53■■□□□ 1.68
P3H1-211ENST00000472802 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.53■■□□□ 1.68
P3H1-211ENST00000472802 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.53■■□□□ 1.68
P3H1-211ENST00000472802 SOGA1O94964 1423 aa25.51■■□□□ 1.67
P3H1-211ENST00000472802 CHD1O14646 1710 aa25.5■■□□□ 1.67
P3H1-211ENST00000472802 CUX1P39880 1505 aa25.49■■□□□ 1.67
P3H1-211ENST00000472802 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
P3H1-211ENST00000472802 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
P3H1-211ENST00000472802 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.47■■□□□ 1.67
P3H1-211ENST00000472802 ARHGEF11O15085 1522 aa25.43■■□□□ 1.66
P3H1-211ENST00000472802 FBLN2P98095 1184 aa25.39■■□□□ 1.66
P3H1-211ENST00000472802 WDR97A6NE52 1622 aa25.33■■□□□ 1.65
P3H1-211ENST00000472802 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.32■■□□□ 1.64
P3H1-211ENST00000472802 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.27■■□□□ 1.64
P3H1-211ENST00000472802 GRIN2BQ13224 1484 aa25.25■■□□□ 1.63
P3H1-211ENST00000472802 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
P3H1-211ENST00000472802 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
P3H1-211ENST00000472802 ARAP1Q96P48 1450 aa25.21■■□□□ 1.63
P3H1-211ENST00000472802 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.19■■□□□ 1.62
P3H1-211ENST00000472802 PBRM1Q86U86 1689 aa25.19■■□□□ 1.62
P3H1-211ENST00000472802 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.18■■□□□ 1.62
P3H1-211ENST00000472802 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.18■■□□□ 1.62
P3H1-211ENST00000472802 SYNJ2O15056 1496 aa25.15■■□□□ 1.62
P3H1-211ENST00000472802 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.15■■□□□ 1.62
P3H1-211ENST00000472802 SYNJ1O43426 1573 aa25.12■■□□□ 1.61
P3H1-211ENST00000472802 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.08■■□□□ 1.61
P3H1-211ENST00000472802 TOP2BQ02880 1626 aa25.08■■□□□ 1.6
P3H1-211ENST00000472802 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
P3H1-211ENST00000472802 GRIN2AQ12879 1464 aa24.94■■□□□ 1.58
P3H1-211ENST00000472802 ADAMTS12P58397 1594 aa24.93■■□□□ 1.58
P3H1-211ENST00000472802 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
P3H1-211ENST00000472802 CEP170Q5SW79 1584 aa24.88■■□□□ 1.57
P3H1-211ENST00000472802 NUP160Q12769 1436 aa24.86■■□□□ 1.57
P3H1-211ENST00000472802 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.86■■□□□ 1.57
P3H1-211ENST00000472802 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.86■■□□□ 1.57
P3H1-211ENST00000472802 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.85■■□□□ 1.57
P3H1-211ENST00000472802 SHROOM2Q13796 1616 aa24.76■■□□□ 1.55
P3H1-211ENST00000472802 JPH4Q96JJ6 628 aa24.64■■□□□ 1.54
P3H1-211ENST00000472802 IGF1RP08069 1367 aa24.62■■□□□ 1.53
P3H1-211ENST00000472802 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
P3H1-211ENST00000472802 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms