RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462474.5

P3H1-209, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene P3H1, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-209ENST00000462474 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.32■■■□□ 2.92
P3H1-209ENST00000462474 ABCC9O60706 1549 aa30.81■■■□□ 2.52
P3H1-209ENST00000462474 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.02■■■□□ 2.4
P3H1-209ENST00000462474 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.47■■■□□ 2.31
P3H1-209ENST00000462474 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.89■■■□□ 2.22
P3H1-209ENST00000462474 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.182e-6■□□□□ 11
P3H1-209ENST00000462474 NACADO15069 1562 aa28.53■■■□□ 2.16
P3H1-209ENST00000462474 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.52■■■□□ 2.16
P3H1-209ENST00000462474 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.3■■■□□ 2.12
P3H1-209ENST00000462474 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.18■■■□□ 2.1
P3H1-209ENST00000462474 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.87■■■□□ 2.05
P3H1-209ENST00000462474 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.74■■■□□ 2.03
P3H1-209ENST00000462474 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.72■■■□□ 2.03
P3H1-209ENST00000462474 SCRIBQ14160 1630 aa27.53■■■□□ 2
P3H1-209ENST00000462474 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.51■■■□□ 2
P3H1-209ENST00000462474 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
P3H1-209ENST00000462474 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
P3H1-209ENST00000462474 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.36■■□□□ 1.97
P3H1-209ENST00000462474 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.3■■□□□ 1.96
P3H1-209ENST00000462474 CUX2O14529 1486 aa26.62■■□□□ 1.85
P3H1-209ENST00000462474 ERCC6Q03468 1493 aa26.56■■□□□ 1.84
P3H1-209ENST00000462474 NCAPD3P42695 1498 aa26.39■■□□□ 1.82
P3H1-209ENST00000462474 NESP48681 1621 aa26.34■■□□□ 1.81
P3H1-209ENST00000462474 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.3■■□□□ 1.8
P3H1-209ENST00000462474 HMGXB3Q12766 1538 aa26.13■■□□□ 1.77
P3H1-209ENST00000462474 SMARCA4P51532 1647 aa26.11■■□□□ 1.77
P3H1-209ENST00000462474 SMARCA2P51531 1590 aa26.1■■□□□ 1.77
P3H1-209ENST00000462474 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
P3H1-209ENST00000462474 TRIM41Q8WV44 630 aa26.03■■□□□ 1.76
P3H1-209ENST00000462474 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
P3H1-209ENST00000462474 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.88■■□□□ 1.73
P3H1-209ENST00000462474 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.86■■□□□ 1.73
P3H1-209ENST00000462474 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
P3H1-209ENST00000462474 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.78■■□□□ 1.72
P3H1-209ENST00000462474 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.75■■□□□ 1.71
P3H1-209ENST00000462474 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.75■■□□□ 1.71
P3H1-209ENST00000462474 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.61■■□□□ 1.69
P3H1-209ENST00000462474 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.6■■□□□ 1.69
P3H1-209ENST00000462474 WDR62O43379 1518 aa25.55■■□□□ 1.68
P3H1-209ENST00000462474 WIZO95785 1651 aa25.4■■□□□ 1.66
P3H1-209ENST00000462474 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.4■■□□□ 1.66
P3H1-209ENST00000462474 OSCARQ8IYS5 282 aa25.35■■□□□ 1.65
P3H1-209ENST00000462474 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.34■■□□□ 1.65
P3H1-209ENST00000462474 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
P3H1-209ENST00000462474 CFTRP13569 1480 aa25.18■■□□□ 1.62
P3H1-209ENST00000462474 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.14■■□□□ 1.61
P3H1-209ENST00000462474 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.14■■□□□ 1.61
P3H1-209ENST00000462474 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.14■■□□□ 1.61
P3H1-209ENST00000462474 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
P3H1-209ENST00000462474 ARHGEF11O15085 1522 aa24.99■■□□□ 1.59
P3H1-209ENST00000462474 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
P3H1-209ENST00000462474 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
P3H1-209ENST00000462474 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.9■■□□□ 1.58
P3H1-209ENST00000462474 IFT140Q96RY7 1462 aa24.88■■□□□ 1.57
P3H1-209ENST00000462474 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
P3H1-209ENST00000462474 TOPBP1Q92547 1522 aa24.8■■□□□ 1.56
P3H1-209ENST00000462474 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
P3H1-209ENST00000462474 PRDM2Q13029 1718 aa24.78■■□□□ 1.56
P3H1-209ENST00000462474 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.76■■□□□ 1.55
P3H1-209ENST00000462474 ARAP1Q96P48 1450 aa24.76■■□□□ 1.55
P3H1-209ENST00000462474 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.555e-8■■■□□ 15.9
P3H1-209ENST00000462474 CHD1O14646 1710 aa24.7■■□□□ 1.54
P3H1-209ENST00000462474 FBLN2P98095 1184 aa24.69■■□□□ 1.54
P3H1-209ENST00000462474 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.62■■□□□ 1.53
P3H1-209ENST00000462474 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
P3H1-209ENST00000462474 ABCC8Q09428 1581 aa24.54■■□□□ 1.52
P3H1-209ENST00000462474 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
P3H1-209ENST00000462474 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.52■■□□□ 1.52
P3H1-209ENST00000462474 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
P3H1-209ENST00000462474 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.44■■□□□ 1.5
P3H1-209ENST00000462474 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
P3H1-209ENST00000462474 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.4■■□□□ 1.5
P3H1-209ENST00000462474 SOGA1O94964 1423 aa24.38■■□□□ 1.49
P3H1-209ENST00000462474 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
P3H1-209ENST00000462474 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.31■■□□□ 1.48
P3H1-209ENST00000462474 SYNJ1O43426 1573 aa24.28■■□□□ 1.48
P3H1-209ENST00000462474 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
P3H1-209ENST00000462474 CUX1P39880 1505 aa24.21■■□□□ 1.47
P3H1-209ENST00000462474 GRIN2BQ13224 1484 aa24.2■■□□□ 1.47
P3H1-209ENST00000462474 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.19■■□□□ 1.46
P3H1-209ENST00000462474 SYNJ2O15056 1496 aa24.19■■□□□ 1.46
P3H1-209ENST00000462474 WDR97A6NE52 1622 aa24.15■■□□□ 1.46
P3H1-209ENST00000462474 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.11■■□□□ 1.45
P3H1-209ENST00000462474 PBRM1Q86U86 1689 aa24.08■■□□□ 1.44
P3H1-209ENST00000462474 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.96■■□□□ 1.43
P3H1-209ENST00000462474 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.94■■□□□ 1.42
P3H1-209ENST00000462474 GRIN2AQ12879 1464 aa23.92■■□□□ 1.42
P3H1-209ENST00000462474 CEP170Q5SW79 1584 aa23.91■■□□□ 1.42
P3H1-209ENST00000462474 ADAMTS12P58397 1594 aa23.85■■□□□ 1.41
P3H1-209ENST00000462474 NUP160Q12769 1436 aa23.84■■□□□ 1.41
P3H1-209ENST00000462474 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.8■■□□□ 1.4
P3H1-209ENST00000462474 SHROOM2Q13796 1616 aa23.77■■□□□ 1.4
P3H1-209ENST00000462474 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
P3H1-209ENST00000462474 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.71■■□□□ 1.39
P3H1-209ENST00000462474 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
P3H1-209ENST00000462474 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.67■■□□□ 1.38
P3H1-209ENST00000462474 JPH4Q96JJ6 628 aa23.62■■□□□ 1.37
P3H1-209ENST00000462474 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.6■■□□□ 1.37
P3H1-209ENST00000462474 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.6■■□□□ 1.37
P3H1-209ENST00000462474 TOP2BQ02880 1626 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms