RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489598.5

ARPC2-217, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene ARPC2, Length 1,039 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytosol, Lamellipodium, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC2-217ENST00000489598 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.51■■■■■ 7.44
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ARPC2-217ENST00000489598 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.47■■■■■ 5.83
ARPC2-217ENST00000489598 NACADO15069 1562 aa51.38■■■■■ 5.82
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ARPC2-217ENST00000489598 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.82■■■■■ 5.73
ARPC2-217ENST00000489598 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.41■■■■■ 5.66
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ARPC2-217ENST00000489598 SCRIBQ14160 1630 aa49.99■■■■■ 5.59
ARPC2-217ENST00000489598 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.96■■■■■ 5.59
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ARPC2-217ENST00000489598 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.45■■■■■ 5.35
ARPC2-217ENST00000489598 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.1■■■■■ 5.29
ARPC2-217ENST00000489598 SMARCA4P51532 1647 aa47.76■■■■■ 5.24
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ARPC2-217ENST00000489598 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.45■■■■■ 5.19
ARPC2-217ENST00000489598 NCAPD3P42695 1498 aa47.4■■■■■ 5.18
ARPC2-217ENST00000489598 SMARCA2P51531 1590 aa47.4■■■■■ 5.18
ARPC2-217ENST00000489598 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.24■■■■■ 5.15
ARPC2-217ENST00000489598 HMGXB3Q12766 1538 aa47.19■■■■■ 5.14
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ARPC2-217ENST00000489598 ERCC6Q03468 1493 aa46.15■■■■■ 4.98
ARPC2-217ENST00000489598 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.04■■■■■ 4.96
ARPC2-217ENST00000489598 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.88■■■■■ 4.94
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ARPC2-217ENST00000489598 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.85■■■■■ 4.93
ARPC2-217ENST00000489598 CFTRP13569 1480 aa45.77■■■■■ 4.92
ARPC2-217ENST00000489598 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
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ARPC2-217ENST00000489598 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.55■■■■■ 4.88
ARPC2-217ENST00000489598 PRDM2Q13029 1718 aa45.5■■■■■ 4.87
ARPC2-217ENST00000489598 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.49■■■■■ 4.87
ARPC2-217ENST00000489598 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.42■■■■■ 4.86
ARPC2-217ENST00000489598 WDR62O43379 1518 aa45.26■■■■■ 4.84
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ARPC2-217ENST00000489598 TOPBP1Q92547 1522 aa44.83■■■■■ 4.77
ARPC2-217ENST00000489598 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.77■■■■■ 4.76
ARPC2-217ENST00000489598 ABCC8Q09428 1581 aa44.74■■■■■ 4.75
ARPC2-217ENST00000489598 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.54■■■■■ 4.72
ARPC2-217ENST00000489598 CUX1P39880 1505 aa44.51■■■■■ 4.72
ARPC2-217ENST00000489598 IFT140Q96RY7 1462 aa44.51■■■■■ 4.72
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ARPC2-217ENST00000489598 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
ARPC2-217ENST00000489598 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.35■■■■■ 4.69
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ARPC2-217ENST00000489598 SOGA1O94964 1423 aa44.25■■■■■ 4.67
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ARPC2-217ENST00000489598 SYNJ1O43426 1573 aa44.14■■■■■ 4.66
ARPC2-217ENST00000489598 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.12■■■■■ 4.652e-9■■■□□ 15.7
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ARPC2-217ENST00000489598 TOP2BQ02880 1626 aa44.11■■■■■ 4.65
ARPC2-217ENST00000489598 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
ARPC2-217ENST00000489598 WDR97A6NE52 1622 aa44■■■■■ 4.63
ARPC2-217ENST00000489598 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.89■■■■■ 4.62
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ARPC2-217ENST00000489598 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.74■■■■■ 4.59
ARPC2-217ENST00000489598 OSCARQ8IYS5 282 aa43.73■■■■■ 4.59
ARPC2-217ENST00000489598 GRIN2BQ13224 1484 aa43.72■■■■■ 4.59
ARPC2-217ENST00000489598 PBRM1Q86U86 1689 aa43.72■■■■■ 4.59
ARPC2-217ENST00000489598 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.7■■■■■ 4.59
ARPC2-217ENST00000489598 CHD1O14646 1710 aa43.68■■■■■ 4.58
ARPC2-217ENST00000489598 FBLN2P98095 1184 aa43.61■■■■■ 4.57
ARPC2-217ENST00000489598 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
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ARPC2-217ENST00000489598 SYNJ2O15056 1496 aa43.44■■■■■ 4.54
ARPC2-217ENST00000489598 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.36■■■■■ 4.53
ARPC2-217ENST00000489598 ADAMTS12P58397 1594 aa43.33■■■■■ 4.53
ARPC2-217ENST00000489598 KIF27Q86VH2 1401 aa43.25■■■■■ 4.51
ARPC2-217ENST00000489598 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.22■■■■■ 4.51
ARPC2-217ENST00000489598 GRIN2AQ12879 1464 aa43.18■■■■■ 4.5
ARPC2-217ENST00000489598 TRIM41Q8WV44 630 aa43.17■■■■■ 4.5
ARPC2-217ENST00000489598 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.14■■■■■ 4.5
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ARPC2-217ENST00000489598 ARHGEF11O15085 1522 aa43.07■■■■■ 4.48
ARPC2-217ENST00000489598 CEP170Q5SW79 1584 aa43■■■■■ 4.47
ARPC2-217ENST00000489598 CUL7Q14999 1698 aa42.98■■■■■ 4.47
ARPC2-217ENST00000489598 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.96■■■■■ 4.47
ARPC2-217ENST00000489598 NUP160Q12769 1436 aa42.96■■■■■ 4.47
ARPC2-217ENST00000489598 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.84■■■■■ 4.45
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ARPC2-217ENST00000489598 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.67■■■■■ 4.42
ARPC2-217ENST00000489598 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.67■■■■■ 4.42
ARPC2-217ENST00000489598 SHROOM2Q13796 1616 aa42.67■■■■■ 4.42
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