Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM2Q9C040 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM2Q9C040 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM2Q9C040 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM2Q9C040 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM2Q9C040 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM2Q9C040 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms