Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUSP9Q99956 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUSP9Q99956 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUSP9Q99956 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUSP9Q99956 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUSP9Q99956 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUSP9Q99956 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUSP9Q99956 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUSP9Q99956 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DUSP9Q99956 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DUSP9Q99956 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUSP9Q99956 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUSP9Q99956 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUSP9Q99956 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUSP9Q99956 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUSP9Q99956 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUSP9Q99956 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUSP9Q99956 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUSP9Q99956 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUSP9Q99956 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUSP9Q99956 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUSP9Q99956 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DUSP9Q99956 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUSP9Q99956 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUSP9Q99956 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms