Protein–RNA interactions for Protein: Q96D42

HAVCR1, Hepatitis A virus cellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR1Q96D42 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HAVCR1Q96D42 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HAVCR1Q96D42 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAVCR1Q96D42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAVCR1Q96D42 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HAVCR1Q96D42 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HAVCR1Q96D42 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAVCR1Q96D42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms