Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS0

DNAJB8, DnaJ homolog subfamily B member 8, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB8Q8NHS0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJB8Q8NHS0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB8Q8NHS0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DNAJB8Q8NHS0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB8Q8NHS0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJB8Q8NHS0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB8Q8NHS0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB8Q8NHS0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB8Q8NHS0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJB8Q8NHS0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB8Q8NHS0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB8Q8NHS0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB8Q8NHS0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms