Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF680Q8NEM1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF680Q8NEM1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF680Q8NEM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF680Q8NEM1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF680Q8NEM1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF680Q8NEM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF680Q8NEM1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms