Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR53Q7Z5U6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR53Q7Z5U6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR53Q7Z5U6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR53Q7Z5U6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR53Q7Z5U6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms