Protein–RNA interactions for Protein: Q7L7L0

HIST3H2A, Histone H2A type 3, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H2AQ7L7L0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIST3H2AQ7L7L0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST3H2AQ7L7L0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST3H2AQ7L7L0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST3H2AQ7L7L0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST3H2AQ7L7L0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST3H2AQ7L7L0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST3H2AQ7L7L0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST3H2AQ7L7L0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST3H2AQ7L7L0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms