Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVX7

NCCRP1, F-box only protein 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCCRP1Q6ZVX7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCCRP1Q6ZVX7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCCRP1Q6ZVX7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCCRP1Q6ZVX7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCCRP1Q6ZVX7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCCRP1Q6ZVX7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCCRP1Q6ZVX7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCCRP1Q6ZVX7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCCRP1Q6ZVX7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCCRP1Q6ZVX7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCCRP1Q6ZVX7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCCRP1Q6ZVX7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCCRP1Q6ZVX7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCCRP1Q6ZVX7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCCRP1Q6ZVX7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCCRP1Q6ZVX7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms