Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCD3Q6STE5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCD3Q6STE5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCD3Q6STE5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCD3Q6STE5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCD3Q6STE5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCD3Q6STE5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCD3Q6STE5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCD3Q6STE5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD3Q6STE5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCD3Q6STE5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCD3Q6STE5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD3Q6STE5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD3Q6STE5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD3Q6STE5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms