Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF880Q6PDB4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF880Q6PDB4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF880Q6PDB4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF880Q6PDB4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF880Q6PDB4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF880Q6PDB4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF880Q6PDB4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF880Q6PDB4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF880Q6PDB4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF880Q6PDB4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF880Q6PDB4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF880Q6PDB4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF880Q6PDB4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF880Q6PDB4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms