Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC8EQ6NSJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC8EQ6NSJ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC8EQ6NSJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC8EQ6NSJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms