Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCK2Q16822 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCK2Q16822 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCK2Q16822 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCK2Q16822 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCK2Q16822 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms