Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD1Q15116 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD1Q15116 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD1Q15116 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCD1Q15116 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD1Q15116 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD1Q15116 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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