Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGALS3BPQ08380 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGALS3BPQ08380 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGALS3BPQ08380 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGALS3BPQ08380 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGALS3BPQ08380 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGALS3BPQ08380 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGALS3BPQ08380 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGALS3BPQ08380 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGALS3BPQ08380 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGALS3BPQ08380 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGALS3BPQ08380 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGALS3BPQ08380 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGALS3BPQ08380 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGALS3BPQ08380 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGALS3BPQ08380 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGALS3BPQ08380 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGALS3BPQ08380 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LGALS3BPQ08380 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGALS3BPQ08380 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGALS3BPQ08380 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGALS3BPQ08380 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGALS3BPQ08380 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGALS3BPQ08380 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGALS3BPQ08380 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGALS3BPQ08380 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGALS3BPQ08380 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms