Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YBX1P67809 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YBX1P67809 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YBX1P67809 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YBX1P67809 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YBX1P67809 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YBX1P67809 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YBX1P67809 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YBX1P67809 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YBX1P67809 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26■■□□□ 1.75
YBX1P67809 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX1P67809 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX1P67809 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX1P67809 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX1P67809 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX1P67809 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX1P67809 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
YBX1P67809 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YBX1P67809 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YBX1P67809 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
YBX1P67809 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YBX1P67809 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YBX1P67809 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YBX1P67809 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YBX1P67809 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX1P67809 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX1P67809 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX1P67809 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YBX1P67809 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YBX1P67809 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YBX1P67809 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YBX1P67809 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
YBX1P67809 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YBX1P67809 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YBX1P67809 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YBX1P67809 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YBX1P67809 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YBX1P67809 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YBX1P67809 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YBX1P67809 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YBX1P67809 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YBX1P67809 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YBX1P67809 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YBX1P67809 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YBX1P67809 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX1P67809 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YBX1P67809 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX1P67809 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBX1P67809 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
YBX1P67809 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YBX1P67809 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YBX1P67809 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YBX1P67809 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YBX1P67809 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YBX1P67809 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
YBX1P67809 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBX1P67809 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBX1P67809 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBX1P67809 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBX1P67809 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBX1P67809 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBX1P67809 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBX1P67809 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBX1P67809 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX1P67809 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX1P67809 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX1P67809 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBX1P67809 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX1P67809 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX1P67809 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBX1P67809 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX1P67809 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX1P67809 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX1P67809 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX1P67809 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX1P67809 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX1P67809 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBX1P67809 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX1P67809 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX1P67809 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX1P67809 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBX1P67809 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YBX1P67809 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX1P67809 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX1P67809 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX1P67809 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX1P67809 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX1P67809 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX1P67809 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX1P67809 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX1P67809 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX1P67809 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX1P67809 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YBX1P67809 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YBX1P67809 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YBX1P67809 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YBX1P67809 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YBX1P67809 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
YBX1P67809 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YBX1P67809 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms