Protein–RNA interactions for Protein: P57086

SCAND1, SCAN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAND1P57086 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAND1P57086 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAND1P57086 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAND1P57086 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAND1P57086 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAND1P57086 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAND1P57086 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAND1P57086 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAND1P57086 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAND1P57086 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAND1P57086 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAND1P57086 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAND1P57086 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms