Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN7P35236 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN7P35236 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN7P35236 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN7P35236 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN7P35236 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN7P35236 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN7P35236 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN7P35236 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN7P35236 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN7P35236 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN7P35236 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN7P35236 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN7P35236 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN7P35236 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN7P35236 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN7P35236 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN7P35236 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN7P35236 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN7P35236 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN7P35236 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN7P35236 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN7P35236 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN7P35236 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN7P35236 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN7P35236 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN7P35236 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN7P35236 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN7P35236 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN7P35236 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN7P35236 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN7P35236 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN7P35236 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN7P35236 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms