Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC25CP30307 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC25CP30307 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC25CP30307 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDC25CP30307 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC25CP30307 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC25CP30307 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC25CP30307 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC25CP30307 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC25CP30307 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC25CP30307 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC25CP30307 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC25CP30307 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms