Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRABP1P29762 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRABP1P29762 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRABP1P29762 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRABP1P29762 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms