Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CASP1P29466 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CASP1P29466 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASP1P29466 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASP1P29466 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASP1P29466 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASP1P29466 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASP1P29466 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASP1P29466 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASP1P29466 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASP1P29466 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP1P29466 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP1P29466 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP1P29466 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASP1P29466 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CASP1P29466 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CASP1P29466 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CASP1P29466 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CASP1P29466 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CASP1P29466 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CASP1P29466 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CASP1P29466 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CASP1P29466 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CASP1P29466 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CASP1P29466 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CASP1P29466 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CASP1P29466 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP1P29466 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP1P29466 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP1P29466 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP1P29466 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP1P29466 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASP1P29466 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CASP1P29466 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CASP1P29466 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CASP1P29466 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CASP1P29466 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CASP1P29466 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CASP1P29466 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CASP1P29466 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CASP1P29466 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASP1P29466 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASP1P29466 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASP1P29466 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASP1P29466 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASP1P29466 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASP1P29466 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASP1P29466 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CASP1P29466 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CASP1P29466 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CASP1P29466 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASP1P29466 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASP1P29466 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASP1P29466 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CASP1P29466 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP1P29466 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP1P29466 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASP1P29466 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CASP1P29466 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CASP1P29466 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASP1P29466 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASP1P29466 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP1P29466 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP1P29466 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP1P29466 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASP1P29466 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASP1P29466 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASP1P29466 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASP1P29466 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASP1P29466 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASP1P29466 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASP1P29466 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASP1P29466 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP1P29466 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP1P29466 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP1P29466 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP1P29466 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP1P29466 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASP1P29466 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASP1P29466 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASP1P29466 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASP1P29466 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASP1P29466 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASP1P29466 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASP1P29466 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASP1P29466 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASP1P29466 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASP1P29466 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASP1P29466 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASP1P29466 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP1P29466 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP1P29466 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP1P29466 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP1P29466 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP1P29466 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP1P29466 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP1P29466 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP1P29466 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP1P29466 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP1P29466 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms