Protein–RNA interactions for Protein: P10644

PRKAR1A, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1AP10644 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAR1AP10644 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAR1AP10644 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAR1AP10644 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAR1AP10644 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAR1AP10644 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAR1AP10644 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAR1AP10644 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAR1AP10644 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAR1AP10644 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAR1AP10644 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAR1AP10644 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAR1AP10644 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAR1AP10644 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAR1AP10644 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAR1AP10644 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1565.6 ms