Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBP08949 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBP08949 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBP08949 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBP08949 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBP08949 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBP08949 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMBP08949 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMBP08949 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMBP08949 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NMBP08949 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NMBP08949 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NMBP08949 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NMBP08949 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NMBP08949 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMBP08949 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMBP08949 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMBP08949 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMBP08949 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NMBP08949 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NMBP08949 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NMBP08949 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NMBP08949 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMBP08949 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMBP08949 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMBP08949 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMBP08949 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMBP08949 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMBP08949 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMBP08949 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMBP08949 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMBP08949 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMBP08949 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMBP08949 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMBP08949 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMBP08949 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMBP08949 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMBP08949 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMBP08949 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMBP08949 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NMBP08949 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMBP08949 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMBP08949 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMBP08949 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMBP08949 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMBP08949 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMBP08949 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMBP08949 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMBP08949 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMBP08949 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMBP08949 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMBP08949 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMBP08949 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMBP08949 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMBP08949 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMBP08949 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMBP08949 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMBP08949 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMBP08949 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMBP08949 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMBP08949 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMBP08949 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMBP08949 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMBP08949 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMBP08949 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMBP08949 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMBP08949 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMBP08949 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBP08949 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBP08949 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBP08949 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBP08949 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBP08949 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBP08949 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBP08949 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBP08949 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBP08949 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NMBP08949 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NMBP08949 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBP08949 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMBP08949 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMBP08949 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMBP08949 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBP08949 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBP08949 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBP08949 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBP08949 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBP08949 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBP08949 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBP08949 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBP08949 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBP08949 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBP08949 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBP08949 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBP08949 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMBP08949 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMBP08949 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMBP08949 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NMBP08949 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NMBP08949 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms