Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8BP07358 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8BP07358 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8BP07358 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8BP07358 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8BP07358 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8BP07358 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C8BP07358 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8BP07358 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8BP07358 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8BP07358 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8BP07358 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8BP07358 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8BP07358 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C8BP07358 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8BP07358 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8BP07358 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8BP07358 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8BP07358 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8BP07358 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8BP07358 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8BP07358 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C8BP07358 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8BP07358 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8BP07358 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8BP07358 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8BP07358 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8BP07358 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8BP07358 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8BP07358 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8BP07358 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8BP07358 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8BP07358 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8BP07358 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8BP07358 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8BP07358 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8BP07358 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8BP07358 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8BP07358 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C8BP07358 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8BP07358 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C8BP07358 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8BP07358 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8BP07358 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8BP07358 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8BP07358 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8BP07358 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8BP07358 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8BP07358 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8BP07358 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8BP07358 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8BP07358 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8BP07358 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8BP07358 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8BP07358 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
C8BP07358 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8BP07358 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8BP07358 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8BP07358 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C8BP07358 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8BP07358 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8BP07358 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8BP07358 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8BP07358 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8BP07358 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8BP07358 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8BP07358 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8BP07358 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8BP07358 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8BP07358 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8BP07358 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8BP07358 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8BP07358 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8BP07358 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8BP07358 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8BP07358 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8BP07358 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8BP07358 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8BP07358 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8BP07358 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8BP07358 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8BP07358 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C8BP07358 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C8BP07358 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C8BP07358 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C8BP07358 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C8BP07358 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C8BP07358 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C8BP07358 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C8BP07358 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C8BP07358 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C8BP07358 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C8BP07358 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C8BP07358 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C8BP07358 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8BP07358 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8BP07358 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8BP07358 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C8BP07358 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C8BP07358 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms