Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNA2P01563 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA2P01563 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFNA2P01563 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA2P01563 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA2P01563 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms