Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNA2P01563 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFNA2P01563 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNA2P01563 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNA2P01563 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNA2P01563 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNA2P01563 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFNA2P01563 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNA2P01563 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNA2P01563 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFNA2P01563 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNA2P01563 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNA2P01563 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNA2P01563 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNA2P01563 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNA2P01563 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNA2P01563 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNA2P01563 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNA2P01563 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNA2P01563 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFNA2P01563 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFNA2P01563 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFNA2P01563 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNA2P01563 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNA2P01563 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNA2P01563 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNA2P01563 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFNA2P01563 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNA2P01563 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNA2P01563 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFNA2P01563 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFNA2P01563 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFNA2P01563 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFNA2P01563 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNA2P01563 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNA2P01563 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNA2P01563 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNA2P01563 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNA2P01563 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNA2P01563 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNA2P01563 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNA2P01563 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFNA2P01563 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNA2P01563 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNA2P01563 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNA2P01563 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFNA2P01563 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNA2P01563 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNA2P01563 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNA2P01563 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNA2P01563 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNA2P01563 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNA2P01563 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNA2P01563 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNA2P01563 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNA2P01563 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNA2P01563 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNA2P01563 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNA2P01563 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNA2P01563 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNA2P01563 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNA2P01563 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNA2P01563 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNA2P01563 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNA2P01563 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNA2P01563 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNA2P01563 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNA2P01563 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNA2P01563 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNA2P01563 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNA2P01563 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNA2P01563 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNA2P01563 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNA2P01563 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNA2P01563 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNA2P01563 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFNA2P01563 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNA2P01563 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNA2P01563 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNA2P01563 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNA2P01563 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNA2P01563 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNA2P01563 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNA2P01563 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFNA2P01563 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNA2P01563 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNA2P01563 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNA2P01563 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNA2P01563 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNA2P01563 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNA2P01563 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNA2P01563 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNA2P01563 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNA2P01563 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNA2P01563 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNA2P01563 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNA2P01563 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNA2P01563 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNA2P01563 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNA2P01563 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290 ms